RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CRBNQ96SW2 442 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMR3AQ99954 134 aa-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PCIF1Q9H4Z3 704 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPAG4Q9NPE6 437 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARL8BQ9NVJ2 186 aa-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNNQ9UQP3 1299 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C2CD2Q9Y426 696 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRAF6Q9Y4K3 522 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 APCP25054 2843 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF233A6NK53 670 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 NPIPB4C9JG80 1138 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF878C9JN71 531 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AGRPO00253 132 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CES2O00748 559 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TBX3O15119 743 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AKR1B10O60218 316 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 UGT1A4P22310 534 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 FMO5P49326 533 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 XKR3Q5GH77 459 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPATC1Q76KD6 591 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CEACAM19Q7Z692 300 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DSG4Q86SJ6 1040 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TSPAN33Q86UF1 283 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC47A2Q86VL8 602 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UEVLDQ8IX04 471 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C2orf69Q8N8R5 385 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC17A8Q8NDX2 589 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRSS33Q8NF86 280 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR14C36Q8NHC7 312 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RFWD2Q8NHY2 731 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MRAPQ8TCY5 172 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BICD2Q8TD16 824 aa-0.63□□□□□ -2.51
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