RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514901.5

NUP54-216, Transcript of nucleoporin 54, humanhuman

TSL 3

Gene NUP54, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54-216ENST00000514901 HCAR3P49019 387 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 IRAK1P51617 712 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ST8SIA6P61647 398 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 SEMA3BQ13214 749 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ENPP2Q13822 863 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 CRY1Q16526 586 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 FUT11Q495W5 492 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 FAM72BQ86X60 149 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TMEM139Q8IV31 216 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 PRSS33Q8NF86 280 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 PEBP4Q96S96 227 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 MUC3BQ9H195 1237 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 WASH4PA8MWX3 477 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 K7ESF4 209 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 NRDCO43847 1150 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 KRT7P08729 469 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TDGF1P13385 188 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 HOXB2P14652 356 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 NNMTP40261 264 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TPI1P60174 286 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ECT2LQ008S8 904 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TCF15Q12870 199 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ZNF234Q14588 700 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 MESDQ14696 234 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 STARD3Q14849 445 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 DPYSL2Q16555 572 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 NLRP14Q86W24 1093 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 APCDD1Q8J025 514 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 NELL1Q92832 810 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ALG14Q96F25 216 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ZWILCHQ9H900 591 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 EBF1Q9UH73 591 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 SUN2Q9UH99 717 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP54-216ENST00000514901 ANTXRLA6NF34 631 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 H0Y858 1186 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 DAPK3O43293 454 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 RARAP10276 462 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 IL1R2P27930 398 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 IL12RB1P42701 662 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 GNA12Q03113 381 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 PTPRNQ16849 979 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 ACOX2Q99424 681 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 MAGEH1Q9H213 219 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 TMEM245Q9H330 911 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 VPS28Q9UK41 221 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 NEU3Q9UQ49 428 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 H3BRJ5 948 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 PJA2O43164 708 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 ARHGAP6O43182 974 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 ARL4AP40617 200 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 WASP42768 502 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 VAV2P52735 878 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 SLC20A2Q08357 652 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 CA9Q16790 459 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 TSSK4Q6SA08 328 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP54-216ENST00000514901 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms