RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 STOML1Q9UBI4 398 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 HESX1Q9UBX0 185 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 MYH10P35580 1976 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ITPR1Q14643 2758 aa7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SLC12A8A0AV02 714 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SMC2O95347 1197 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 KLKB1P03952 638 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 HMBSP08397 361 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ACADMP11310 421 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 RAD23BP54727 409 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 MFAP3P55082 362 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CUL2Q13617 745 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 MPPE1Q53F39 396 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SGO2Q562F6 1265 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 RAB41Q5JT25 222 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 FYB2Q5VWT5 728 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PIP4P1Q86T03 277 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PIGZQ86VD9 579 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 DENND1CQ8IV53 801 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CPXM2Q8N436 756 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 DEFB119Q8N690 84 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 DDI1Q8WTU0 396 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 RNF139Q8WU17 664 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SEMA4DQ92854 862 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 GSDMAQ96QA5 445 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CIPCQ9C0C6 399 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CD248Q9HCU0 757 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 WASF3Q9UPY6 502 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 RAD54BQ9Y620 910 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.5□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 A0A1B0GTW7 788 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 MEI4A8MW99 385 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 WASH3PC4AMC7 463 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 WISP1O95388 367 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 LATS1O95835 1130 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 IGLV1-40P01703 118 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SETSIPP0DME0 302 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 VDRP11473 427 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 NCAM1P13591 858 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CD19P15391 556 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 LRRC63Q05C16 580 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PDE4CQ08493 712 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 CETN1Q12798 172 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 STIM1Q13586 685 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ENPP2Q13822 863 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 GEN1Q17RS7 908 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 FUT11Q495W5 492 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 TMPRSS6Q8IU80 811 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 NUP58Q9BVL2 599 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 GPR174Q9BXC1 333 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.49□□□□□ -1.21
USP46-208ENST00000512656 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms