RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ERBINQ96RT1 1412 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 COL24A1Q17RW2 1714 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 QSER1Q2KHR3 1735 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 JCADQ9P266 1359 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3EA0A087X179 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3BA6NDS4 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 DRGXA6NNA5 263 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 A8MZ25 164 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3LB9A6J9 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 STX6O43752 255 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3HP0C7X1 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 MTHFSP49914 203 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ALDH3A2P51648 485 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 HSD17B4P51659 736 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RCAN1P53805 252 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SNX16P57768 344 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TNFAIP1Q13829 316 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 GPR162Q16538 588 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 GSTA3Q16772 222 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf22Q49AR2 442 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CDC73Q6P1J9 531 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHH3Q7Z736 793 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 DTX2Q86UW9 622 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CREBRFQ8IUR6 639 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ST8SIA2Q92186 375 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ARSGQ96EG1 525 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SPAG5Q96R06 1193 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CENPOQ9BU64 300 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CXorf36Q9H7Y0 433 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 KAT14Q9H8E8 782 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 PFDN4Q9NQP4 134 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 PSD3Q9NYI0 1048 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 NTMQ9P121 344 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RIMKLBQ9ULI2 386 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 NR2E1Q9Y466 385 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 KCNE2Q9Y6J6 123 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 DUOX2Q9NRD8 1548 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 STRCP1A6NGW2 1772 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 KIF1AQ12756 1690 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 MYADML2A6NDP7 307 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM247A6NEH6 219 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 KIF28PB7ZC32 967 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ERN1O75460 977 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ONECUT2O95948 504 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA31D3P0C874 917 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM225BP0DP42 221 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RPS6KA3P51812 740 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RAP2BP61225 183 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 FAM187BQ17R55 369 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CRY2Q49AN0 593 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 C9orf152Q5JTZ5 239 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 COLEC12Q5KU26 742 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL35Q6PF15 583 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 HTR3DQ70Z44 454 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 OR8H3Q8N146 312 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SHCBP1Q8NEM2 672 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 MDGA1Q8NFP4 955 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 FEZF2Q8TBJ5 459 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 VPS50Q96JG6 964 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 FIZ1Q96SL8 496 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TTYH3Q9C0H2 523 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ODF2LQ9ULJ1 636 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms