RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481269.1

CSNK2B-208, Transcript of casein kinase 2 beta, human

TSL 2

Gene CSNK2B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2B-208	ENST00000481269	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	F8	P00451	2351 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	HSF2BP	O75031	334 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	RTN2	O75298	545 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SOAT2	O75908	522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CKM	P06732	381 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SFTPC	P11686	197 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	WEE1	P30291	646 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SCNN1A	P37088	669 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPD2	P43304	727 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	RGS7	P49802	495 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TUB	P50607	506 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	KIF11	P52732	1056 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TAF10	Q12962	218 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	PTPRD	P23468	1912 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269		A1L4Q6	167 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ENC1	O14682	589 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM87A	P0C7U9	286 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	KRT83	P78385	493 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	BNC1	Q01954	994 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CENPC	Q03188	943 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	EXTL1	Q92935	676 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269		E5RJQ4	531 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	LTF	P02788	710 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ITGB2	P05107	769 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	C1S	P09871	688 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SKIL	P12757	684 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPR15	P49685	360 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CDR1	P51861	262 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	NOMO3	P69849	1222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	FMO1	Q01740	532 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	NR1H3	Q13133	447 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CSNK2B-208	ENST00000481269	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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