RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PDHBP11177 359 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNA2P16389 499 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MCM7P33993 719 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 STAT5BP51692 787 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 RAC3P60763 192 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ASIC1P78348 528 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF543Q08ER8 600 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 KLRB1Q12918 225 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TGIF1Q15583 401 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 FUKQ8N0W3 1084 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LEMD2Q8NC56 503 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 IGSF8Q969P0 613 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 C5orf34Q96MH7 638 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRCC1Q9C099 1032 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CD93Q9NPY3 652 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 OBP2AQ9NY56 170 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ARL5CA6NH57 179 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 HBP1O60381 514 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF217O75362 1048 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LTFP02788 710 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 GABRG2P18507 467 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCB4P21439 1286 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ADD2P35612 726 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MLH1P40692 756 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TDO2P48775 406 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 GPC3P51654 580 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ART1P52961 327 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ARPP19P56211 112 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TWF1Q12792 350 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP4K2Q12851 820 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 EOGTQ5NDL2 527 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MANEAQ5SRI9 462 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR158Q5T848 1215 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CD276Q5ZPR3 534 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LAYNQ6UX15 382 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 VASH2Q86V25 355 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CPA6Q8N4T0 437 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX19Q8NA77 164 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP89Q96ST8 783 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 MIOSQ9NXC5 875 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP72Q9P209 647 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ACANP16112 2415 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF212BA8MTL3 300 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS44E7EML9 344 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 AGRPO00253 132 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 GRID2O43424 1007 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC24AO95486 1093 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 COL6A2P12110 1019 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 CKMT2P17540 419 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 GRIA2P42262 883 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 E2F1Q01094 437 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ROR1Q01973 937 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 DPTQ07507 201 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 FXNQ16595 210 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM198Q66K66 360 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 PHC2Q8IXK0 858 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ARL14Q8N4G2 192 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX19Q92543 992 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms