RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM50BQ9Y247 325 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDAQ9Y2T3 454 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR2E1Q9Y466 385 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF3AQ9Y496 699 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FANCMQ8IYD8 2048 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC169A6NNP5 214 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTSS1O43312 755 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCXO43602 365 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 OFD1O75665 1012 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYPLA2O95372 231 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPA1P27694 616 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL2P36404 184 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX3P56589 373 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNT3AP56704 352 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSTNP61366 133 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM189BP81408 668 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT17Q04695 432 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL17AQ16552 155 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK6Q16659 721 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM31Q5JXX7 168 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC181Q5TID7 509 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM124AQ86V42 546 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 KAT5Q92993 513 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDAC10Q969S8 669 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGBD4Q96DM1 585 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAAR9Q96RI9 348 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPHA2Q96T91 129 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 POMKQ9H5K3 350 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHST12Q9NRB3 414 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP54Q96N23 3096 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNA1HO95180 2353 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 VSTM5A8MXK1 200 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 I3L4J1 428 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7ENM7 598 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGESO14684 152 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRP1O14786 923 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC16A4O15374 487 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCK2O43639 380 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGA10O75578 1167 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCL14O95715 111 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALTP07902 379 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA31D3P0C874 917 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSAP10619 480 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECHS1P30084 290 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAMPTP43490 491 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC10P48553 1259 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLUD2P49448 558 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42EP1Q00587 391 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSC2Q02487 901 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIK3Q13003 919 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 COASYQ13057 564 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK7Q13164 816 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAGE13Q4V321 117 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPECC1Q5M775 1068 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT79Q5XKE5 535 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUT10Q6P4F1 479 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 BORAQ6PGQ7 559 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPBP1Q86WP2 473 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.81□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms