RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MARK1Q9P0L2 795 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HPCAL4Q9UM19 191 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRFAP1Q9Y605 127 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DFFAO00273 331 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FANCGO15287 622 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFSD11O43934 449 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP17A1P05093 508 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TYRP14679 529 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL9P15248 144 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL4RP24394 825 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDST2P52849 883 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PFKPQ01813 784 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RUNX3Q13761 415 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALFQ53S48 1182 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NLRP14Q86W24 1093 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADHFE1Q8IWW8 467 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PQLC3Q8N755 202 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLD5Q8N7P1 536 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RIN3Q8TB24 985 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NSMCE1Q8WV22 266 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MS4A14Q96JA4 679 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFYVE19Q96K21 471 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGEB5Q9BZ81 275 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGEH1Q9H213 219 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00597Q9H2U6 94 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ECT2Q9H8V3 914 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLK2Q9NYY3 685 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BRWD1Q9NSI6 2320 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DOCK8Q8NF50 2099 aa10.53□□□□□ -0.72
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ILVBLA1L0T0 632 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTAGE15A4D2H0 777 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HACD1B0YJ81 288 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H7C0C1 242 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC188H7C350 402 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP33O14559 1287 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNTN5O94779 1100 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTAGE8P0CG41 777 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARSAP15289 507 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACTN2P35609 894 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP5OP48047 213 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SGSHP51688 502 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LMNB2Q03252 620 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC12A1Q13621 1099 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOMO1Q15155 1222 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FYB2Q5VWT5 728 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL31Q6EBC2 164 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTAGE6Q86UF2 777 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM25Q86YD3 366 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CREG2Q8IUH2 290 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTAGE4Q8IX94 777 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCNYQ8ND76 341 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACTL9Q8TC94 416 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNASE1L2Q92874 299 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASIC4Q96FT7 647 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC114Q96M63 670 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC3BQ96PB8 259 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP1M1Q9BXS5 423 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNK12Q9HB15 430 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SP110Q9HB58 689 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VPS28Q9UK41 221 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEU3Q9UQ49 428 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SZT2Q5T011 3432 aa10.52□□□□□ -0.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFAP69A5D8W1 941 aa10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms