RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PSMC3P17980 439 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 LMO1P25800 156 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TMOD1P28289 359 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 OR1G1P47890 313 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 GZMKP49863 264 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SLC26A2P50443 739 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 GHRHRQ02643 423 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZS52 159 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf74Q86VG3 221 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TICAM2Q86XR7 235 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CUL5Q93034 780 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CHST12Q9NRB3 414 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SYBUQ9NX95 663 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MYH7P12883 1935 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MASP2O00187 686 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SLC28A2O43868 658 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ATP9AO75110 1047 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 OFD1O75665 1012 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ASMTLO95671 621 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 C21orf58P58505 322 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 USP41Q3LFD5 358 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 COLEC12Q5KU26 742 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PDXDC1Q6P996 788 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PIGKQ92643 395 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SDF4Q9BRK5 362 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 FNIP2Q9P278 1114 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 COL1A2P08123 1366 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 BPTFQ12830 3046 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 AKAP13Q12802 2813 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRK-211ENST00000429595 GPR32O75388 356 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DDHD2O94830 711 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 KCNA2P16389 499 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TYRP1P17643 537 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 CSRP3P50461 194 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 RAB27AP51159 221 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP2Q05923 314 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SEMA3BQ13214 749 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MTMR1Q13613 665 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MAPK6Q16659 721 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PIP4P1Q86T03 277 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 HOMER1Q86YM7 354 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DKK4Q9UBT3 224 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 DCLK1O15075 740 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEB2O15479 319 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 POMCP01189 267 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ENGP17813 658 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 HOXA9P31269 272 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 PDE1AP54750 535 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ACTR2P61160 394 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MGAT5Q09328 741 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 ANKS6Q68DC2 871 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-211ENST00000429595 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.8□□□□□ -1.32
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