RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAPN11Q9UMQ6 739 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNX10Q9Y5X0 201 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RTN2O75298 545 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FTLP02792 175 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SERPING1P05155 500 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF806P0C7X5 589 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD6P30203 668 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADRA1BP35368 520 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ID4P47928 161 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLK1P53350 603 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC6Q16204 474 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C5orf22Q49AR2 442 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACCSLQ4AC99 568 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFHC2Q5JST6 749 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYCP2LQ5T4T6 812 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LYSMD4Q5XG99 296 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FRMD1Q8N878 549 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF214Q8ND24 703 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FOXJ1Q92949 421 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNPY3Q9BT09 278 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD248Q9HCU0 757 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PARD6AQ9NPB6 346 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRSS16Q9NQE7 514 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANLNQ9NQW6 1124 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR12D3Q9UGF7 316 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCINQ9Y6U3 715 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CKAP5Q14008 2032 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP192Q8TEP8 1941 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUP205Q92621 2012 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DRGXA6NNA5 263 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNTN5O94779 1100 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYBL1P10243 752 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PSMA2P25787 234 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PBX1P40424 430 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUMBP49757 651 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TPMTP51580 245 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COPAP53621 1224 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBTB16Q05516 673 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF33AQ06730 810 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM14Q14142 442 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BNIPLQ7Z465 357 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB119Q8N690 84 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF653Q96CK0 615 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPP6Q9NZW5 540 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCML1Q9UN30 329 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ITIH6Q6UXX5 1313 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MEI4A8MW99 385 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC34A8MYJ7 566 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.374e-10■■□□□ 14.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCP110O43303 1012 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SIN3BO75182 1162 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF8O76064 485 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TGM1P22735 817 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASP14P31944 242 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ETFBP38117 255 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTGER3P43115 390 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IRAK1P51617 712 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AIF1P55008 147 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HDAC4P56524 1084 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAMLD1Q13495 774 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms