RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 TRABD2AQ86V40 505 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SERPINB11Q96P15 392 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 L3MBTL1Q9Y468 752 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.54■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 RAG1P15918 1043 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PTPN3P26045 913 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 TBX4P57082 545 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ZBTB17Q13105 803 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 RIPK1Q13546 671 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 USP33Q8TEY7 942 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 MTRRQ9UBK8 725 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 FAM92AA1XBS5 289 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SLC8A1P32418 973 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 MIEF2Q96C03 454 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 E9PAM4 449 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ASMTLO95671 621 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 MAGEA6P43360 314 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SEMA5AQ13591 1074 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PPP2R5DQ14738 602 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ASRGL1Q7L266 308 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 AGAP11Q8TF27 550 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ARMC5Q96C12 935 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SLC39A13Q96H72 371 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 SMAPO00193 183 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 USP12O75317 370 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 ALADP13716 330 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 KLHL29Q96CT2 875 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.52■■□□□ 1.04
C10orf55-202ENST00000412307 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 GALNT2Q10471 571 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 SPATA17Q96L03 361 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 UBP1Q9NZI7 540 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 A0A1W2PPM1 405 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 SLC12A8A0AV02 714 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 OPHN1O60890 802 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 CSPG5O95196 566 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 JCHAINP01591 159 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 MANEALQ5VSG8 457 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 DNAJC3Q13217 504 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 RNF43Q68DV7 783 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM169Q96HH4 297 aa21.5■■□□□ 1.03
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms