RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	PRR23A	A6NEV1	266 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	LRIG2	O94898	1065 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	AIF1	P55008	147 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	STARD3	Q14849	445 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF366	Q8N895	744 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC42	Q96M95	316 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	PEBP4	Q96S96	227 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		32.7	■■■□□ 2.83
OLFM1-208	ENST00000392991	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		32.7	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	USP34	Q70CQ2	3546 aa		32.7	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	CKAP5	Q14008	2032 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	LRCH4	O75427	683 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	EPHX1	P07099	455 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RHOC	P08134	193 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	NDUFV2	P19404	249 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ECT2L	Q008S8	904 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	BTBD6	Q96KE9	485 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		32.69	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RNF8	O76064	485 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	MIP	P30301	263 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	L1CAM	P32004	1257 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SEMA3B	Q13214	749 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	NLRP14	Q86W24	1093 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	OR1E1	P30953	314 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	H2AFV	Q71UI9	128 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	KDM1B	Q8NB78	822 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	MUC3B	Q9H195	1237 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		32.67	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	MRE11	P49959	708 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	COPA	P53621	1224 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PGBD3	Q8N328	593 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PSMB7	Q99436	277 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	MTG2	Q9H4K7	406 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	VPS28	Q9UK41	221 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	INVS	Q9Y283	1065 aa		32.66	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	FRYL	O94915	3013 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991		A0A0D9SEW6	157 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	DCLK1	O15075	740 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	TMEM253	P0C7T8	217 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RHOQ	P17081	205 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ST8SIA6	P61647	398 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SULT2A1	Q06520	285 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ACAP1	Q15027	740 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	CA9	Q16790	459 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		32.65	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ILVBL	A1L0T0	632 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	TCF4	P15884	667 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PCK1	P35558	622 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	LPAL2	Q16609	132 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	CEP68	Q76N32	757 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RLN3	Q8WXF3	142 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	USP18	Q9UMW8	372 aa		32.64	■■■□□ 2.82
OLFM1-208	ENST00000392991	TTC34	A8MYJ7	566 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	PRPSAP2	O60256	369 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	GFRA3	O60609	400 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	P2RY2	P41231	377 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
OLFM1-208	ENST00000392991	OR7D4	Q8NG98	312 aa		32.63	■■■□□ 2.81

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