RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 METAP1P53582 386 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CDH4P55283 916 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CDH18Q13634 790 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC18A3Q16572 532 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LPAL2Q16609 132 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLK5Q496M5 336 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EOGTQ5NDL2 527 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ANO7Q6IWH7 933 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM139Q8IV31 216 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CHPFQ8IZ52 775 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AHI1Q8N157 1196 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NETO2Q8NC67 525 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KNL1Q8NG31 2342 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OR7D4Q8NG98 312 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SHROOM3Q8TF72 1996 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FRS2Q8WU20 508 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GAB3Q8WWW8 586 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PIEZO1Q92508 2521 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PTPRN2Q92932 1015 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EXOC4Q96A65 974 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NTAN1Q96AB6 310 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ACDQ96AP0 544 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IQCDQ96DY2 449 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FAM129BQ96TA1 746 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CNPY3Q9BT09 278 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM5Q9C035 493 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CIPCQ9C0C6 399 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KLC2Q9H0B6 622 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SPTLC3Q9NUV7 552 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PARVAQ9NVD7 372 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SALL4Q9UJQ4 1053 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD36A6QL64 1941 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLXNA2O75051 1894 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ILVBLA1L0T0 632 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD62A6NC57 917 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SOWAHDA6NJG2 315 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 WASH4PA8MWX3 477 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLK4O00444 970 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ATP9BO43861 1147 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GFRA3O60609 400 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SIN3BO75182 1162 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CLDN11O75508 207 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PROSCO94903 275 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LCA5LO95447 670 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TPM3P06753 285 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EPHX1P07099 455 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CTSLP07711 333 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RHOCP08134 193 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms