RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.52□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 A0A1W2PP55 124 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 F5H5T6 163 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 MID1O15344 667 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 MAGEC1O60732 1142 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CAPNS1P04632 268 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 C1SP09871 688 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ZNF18P17022 549 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 C5AR1P21730 350 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CD38P28907 300 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SLC8A1P32418 973 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CCR5P51681 352 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 GALCP54803 685 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SNX16P57768 344 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 BEND5Q7L4P6 421 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PDZD3Q86UT5 571 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CHSY1Q86X52 802 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 LGI2Q8N0V4 545 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.51□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 A0A1B0GTQ1 180 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SYCE3A1L190 88 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 DKK1O94907 266 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 IL1BP01584 269 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 IGHV4-34P06331 123 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ATP1A3P13637 1013 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 GOT1P17174 413 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 NUDT1P36639 197 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PSMD8P48556 350 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 KLK7P49862 253 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 MEA1Q16626 185 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 STK32AQ8WU08 396 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 RNF34Q969K3 372 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 NXPE2Q96DL1 559 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 RAXQ9Y2V3 346 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.5□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 KCNK3O14649 394 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 ENC1O14682 589 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 JUPP14923 745 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 IL9RQ01113 521 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 HS1BP3Q53T59 392 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 DCAF6Q58WW2 860 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CITED1-202ENST00000373619 LAYNQ6UX15 382 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms