RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 USP49Q70CQ1 688 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM25Q86YD3 366 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 TERB1Q8NA31 727 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 BVESQ8NE79 360 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CEP76Q8TAP6 659 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SCFD1Q8WVM8 642 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 TTC9Q92623 222 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 PTPRN2Q92932 1015 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 HPS3Q969F9 1004 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 BTBD6Q96KE9 485 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 MYRFLQ96LU7 910 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 ACCSQ96QU6 501 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 KCNK16Q96T55 309 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 GPR174Q9BXC1 333 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 BBS2Q9BXC9 721 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 PANK2Q9BZ23 570 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CCSER1Q9C0I3 900 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.67e-7■■■■□ 23.7
TMLHE-202ENST00000369439 GAREM1Q9H706 876 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 KCND2Q9NZV8 630 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 DEC1Q9P2X7 70 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 ITGA11Q9UKX5 1188 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CDH9Q9ULB4 789 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 NME7Q9Y5B8 376 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 KNL1Q8NG31 2342 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.03□□□□□ -1.6
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 BPTFQ12830 3046 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 LAMA5O15230 3695 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 A0A1B0GVT2 93 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 A0A1W2PQF6 199 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 A8MXQ7 604 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 PRRT4C9JH25 899 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 CBX4O00257 560 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 NRDCO43847 1150 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 CLEC3AO75596 197 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 TBX18O95935 607 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 HMBSP08397 361 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 JMJD7P0C870 316 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 NCAM1P13591 858 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 KRT10P13645 584 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 TYRP14679 529 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 GNSP15586 552 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 EPHA1P21709 976 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 YWHAQP27348 245 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 ITPKBP27987 946 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 GJB2P29033 226 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 PGFP49763 221 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 PDE6CP51160 858 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 CYP2J2P51589 502 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 SLC5A3P53794 718 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 TNNC1P63316 161 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 SLC7A9P82251 487 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 SLC6A19Q695T7 634 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 FAM171BQ6P995 826 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 DHRS13Q6UX07 377 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 VSTM1Q6UX27 236 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms