RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GGCXP38435 758 aa7.9□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK8P45983 427 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CXCR3P49682 368 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 IRAK1P51617 712 aa7.9□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 ECT2LQ008S8 904 aa7.9□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 DEUP1Q05D60 604 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A1Q13621 1099 aa7.9□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 MTG2Q9H4K7 406 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 WDCPQ9H6R7 721 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN10Q9HC96 672 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM51Q9NW97 253 aa7.89□□□□□ -1.15
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