RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NCAM2O15394 837 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MMP3P08254 477 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SV2CQ496J9 727 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PID1Q7Z2X4 250 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 STRA8Q7Z7C7 330 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NME8Q8N427 588 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SETD4Q9NVD3 440 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF358Q9NW07 568 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 GNAT1P11488 350 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NPR3P17342 541 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 AXLP30530 894 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 HCAR3P49019 387 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CSRP3P50461 194 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CES3Q6UWW8 571 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PYDC1Q8WXC3 89 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 OPTNQ96CV9 577 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 RTKNQ9BST9 563 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 COG4Q9H9E3 785 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MID2Q9UJV3 735 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 POMPQ9Y244 141 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PLXNB2O15031 1838 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 M0QYT0 321 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TIMM44O43615 452 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CREB3O43889 395 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 COX4I1P13073 169 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 HK2P52789 917 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MTTPP55157 894 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ASPHQ12797 758 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf91Q3C1V1 193 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 FRMD7Q6ZUT3 714 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MFN1Q8IWA4 741 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 FBXW8Q8N3Y1 598 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NETO2Q8NC67 525 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PIGVQ9NUD9 493 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SBF1O95248 1867 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NRCAMQ92823 1304 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 A0A096LPK6 155 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MTSS1O43312 755 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB14O43829 449 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA4LO95757 839 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2B6P20813 491 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 GLDCP23378 1020 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 EPHB1P54762 984 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 KLF10Q13118 480 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 OSTM1Q86WC4 334 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF781Q8N8C0 355 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SH3GL3Q99963 347 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 GBA3Q9H227 469 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEB16A2A368 324 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 KCNK1O00180 336 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM13O60858 407 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 HUS1O60921 280 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 APOA4P06727 396 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 FAM163BP0C2L3 166 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2C9P11712 490 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ADRA1BP35368 520 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 HADHAP40939 763 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ERFP50548 548 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CCNA1P78396 465 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TP53INP2Q8IXH6 220 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 RDH11Q8TC12 318 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 SLC26A7Q8TE54 656 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 CNDP1Q96KN2 507 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 KCNK16Q96T55 309 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PIDD1Q9HB75 910 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 DCXO43602 365 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PEX1O43933 1283 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 PDE5AO76074 875 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD1-201ENST00000331462 ERCC2P18074 760 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms