RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 KCNMA1Q12791 1236 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 FGD3Q5JSP0 725 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 OAZ1P54368 228 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 Q96MT0 163 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TGFB3P10600 412 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MYL6P60660 151 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 RAB2AP61019 212 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 RORBQ92753 470 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MAGEC1O60732 1142 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ALDH2P05091 517 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MTF1Q14872 753 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ACOT1Q86TX2 421 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MYDGFQ969H8 173 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 DYTNA2CJ06 578 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 JCHAINP01591 159 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MYBL2P10244 700 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 DGKAP23743 735 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 PSEN1P49768 467 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 RNF44Q7L0R7 432 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 BNIPLQ7Z465 357 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 GMCL1Q96IK5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 A0A087X1B8 175 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ITGA2P17301 1181 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 LRPAP1P30533 357 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 EPC2Q52LR7 807 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 COMMD9Q9P000 198 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SDK2Q58EX2 2172 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CTSEP14091 401 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 PTSQ03393 145 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 NOD2Q9HC29 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 FAM50BQ9Y247 325 aa9.49□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 EPORP19235 508 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TMC2Q8TDI7 906 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 C1orf50Q9BV19 199 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CCZ1BP86790 482 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SPIDRQ14159 915 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TTC23Q5W5X9 447 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MIEF2Q96C03 454 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SERPINB7O75635 380 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CAMTA2O94983 1202 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SERPINE1P05121 402 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 CRATP43155 626 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 SUSD6Q92537 303 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 OMDQ99983 421 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ASAH2Q9NR71 780 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 A0A087WXM4 84 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 UBE2QL1A1L167 161 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 MSCO60682 206 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 ASGR1P07306 291 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 BGNP21810 368 aa9.48□□□□□ -0.89
CUX1-201ENST00000292535 GLRBP48167 497 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms