RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 TPSAB1Q15661 275 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTC3P53804 2025 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOMM70O94826 608 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSH1P0DML2 217 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSH2P0DML3 217 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 CBX3Q13185 183 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPHS2Q9NP85 383 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 OPHN1O60890 802 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 IRX4P78413 519 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAC4Q86UU9 113 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 MZB1Q8WU39 189 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP6V1C1P21283 382 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC39Q96DD0 335 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT38O76015 456 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALDH1A1P00352 501 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 F9P00740 461 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 GJA8P48165 433 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACLYP53396 1101 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 FITM2Q8N6M3 262 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP33Q8TEY7 942 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOL2Q9BQE5 337 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBP1Q9NZI7 540 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DPYSQ14117 519 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAET1EQ8TD07 263 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 HHLA1C9JL84 531 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 TM9SF1O15321 606 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRPA1O75762 1119 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 WASHC5Q12768 1159 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SETDB1Q15047 1291 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB41Q5JT25 222 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 FYB2Q5VWT5 728 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ISLR2Q6UXK2 745 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOPT1Q96IL0 206 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRIG2O94898 1065 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSTA1P08263 222 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARPP19P56211 112 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPWQ8N729 165 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC9A7Q96T83 725 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DSEQ9UL01 958 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DFFAO00273 331 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCLK1O15075 740 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEB3O15480 346 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEA6P43360 314 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC18A1P54219 525 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP2R5DQ14738 602 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCA5Q86VQ0 697 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 HIC2Q96JB3 615 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 PARP6Q2NL67 630 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALADP13716 330 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 GLUD2P49448 558 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 DSC3Q14574 896 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC78A2IDD5 438 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 BGNP21810 368 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms