RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 SCAMP1O15126 338 aa17.03■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A2P31639 672 aa17.03■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CASRP41180 1078 aa17.03■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 USP28Q96RU2 1077 aa17.03■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.03■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 ASLP04424 464 aa17.02■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 METAP1P53582 386 aa17.02■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 POM121L1PQ3SYA9 428 aa17.02■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 RRAGBQ5VZM2 374 aa17.02■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 TWNKQ96RR1 684 aa17.02■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ADNPQ9H2P0 1102 aa17.02■□□□□ 0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 STX6O43752 255 aa17■□□□□ 0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 CRTC1Q6UUV9 634 aa17■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SV2BQ7L1I2 683 aa17■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHO2Q8TD55 490 aa17■□□□□ 0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 SLFN14P0C7P3 912 aa16.99■□□□□ 0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ASPAP45381 313 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 CASP4P49662 377 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 BIRC3Q13489 604 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A14Q15043 492 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PERM1Q5SV97 790 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 AGBL4Q5VU57 503 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 VASH2Q86V25 355 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 OR13H1Q8NG92 308 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 IFT43Q96FT9 208 aa16.99■□□□□ 0.31
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