RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.27■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CHST12Q9NRB3 414 aa15.27■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TMEM216Q9P0N5 145 aa15.27■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CCND1P24385 295 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 IRF5Q13568 498 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 WLSQ5T9L3 541 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 RINLQ6ZS11 566 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 DCLK2Q8N568 766 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 AGR3Q8TD06 166 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SAR1AQ9NR31 198 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 KLF11O14901 512 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 F9P00740 461 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CXCR3P49682 368 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SCAPQ12770 1279 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 C7orf26Q96N11 449 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 BPTFQ12830 3046 aa15.26■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 56.9
USP10-201ENST00000219473 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CCDC22O60826 627 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MX2P20592 715 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SERPINB6P35237 376 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GP5P40197 560 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SESN3P58005 492 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 PRKCZQ05513 592 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CBLBQ13191 982 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MOCOSQ96EN8 888 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SNX15Q9NRS6 342 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 C9IYK1 514 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 PLIN3O60664 434 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GLRA3O75311 464 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CNTFP26441 200 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MAP2K2P36507 400 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 LPIN1Q14693 890 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TREML1Q86YW5 311 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 KIRREL3Q8IZU9 778 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 FBXO27Q8NI29 283 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ACBD6Q9BR61 282 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 NAT9Q9BTE0 207 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GBA3Q9H227 469 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GSRP00390 522 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 IRF9Q00978 393 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CCNJLQ8IV13 435 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GPATCH11Q8N954 259 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 IPMKQ8NFU5 416 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 RSPH1Q8WYR4 309 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MPP6Q9NZW5 540 aa15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TSC2P49815 1807 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 A0A0U1RQF3 1178 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 KPNA6O60684 536 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 NMBRP28336 390 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SLC5A3P53794 718 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TSPY1Q01534 308 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 MGAT3Q09327 533 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 ITGA9Q13797 1035 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 POU6F1Q14863 301 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 CNTD1Q8N815 330 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 GPR152Q8TDT2 470 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 APBB2Q92870 758 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 HDAC11Q96DB2 347 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 KCNK4Q9NYG8 393 aa15.24■□□□□ 0.03
USP10-201ENST00000219473 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms