RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nrip1Q8CBD1 1161 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alg1Q921Q3 482 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ophn1Q99J31 802 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Anks3Q9CZK6 655 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cpxm2Q9D2L5 764 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrelpQ9JK53 378 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oaz3Q9R109 243 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pex11bQ9Z210 259 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam171a2A2A699 822 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc24E9PUW8 296 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsta4P24472 222 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps24P62849 133 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smad1P70340 465 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam8a1Q3URQ4 399 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gngt1Q61012 74 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Soat1Q61263 540 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aldh1a2Q62148 518 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpy19l3Q71B07 716 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccnt2Q7TQK0 723 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp454Q80Y34 536 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ldlrap1Q8C142 308 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atg14Q8CDJ3 492 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kremen2Q8K1S7 461 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 MgarpQ8VI64 283 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2c55Q9D816 490 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mpp6Q9JLB0 553 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcp10cE9Q046 482 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3424L7N298 263 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8246M0QWX9 263 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts8P57110 905 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 PhbP67778 272 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lsmem1Q3UQS2 128 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 TceancQ3US16 359 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxd4Q60688 444 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grik1Q60934 836 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pknox2Q8BG99 474 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shc2Q8BMC3 573 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iffo1Q8BXL9 562 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm16430A6X8J1 155 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifi206G3UZV2 921 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfrsf11bO08712 401 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 FaahO08914 579 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkag1O54950 330 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aff1O88573 1216 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 MaptP10637 733 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc6a13P31649 602 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shroom1Q5SX79 823 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nlrp4eQ66X19 978 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 SrlQ7TQ48 910 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ofcc1Q8BGX4 166 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Setd7Q8VHL1 366 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdhb18Q91Y02 792 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gprc5bQ923Z0 410 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col5a3Q9JLI2 1739 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5415E9PXF3 478 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h12bG3X9I7 835 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt10P02535 570 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il12aP43431 215 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bdkrb1Q61125 334 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf148Q61624 794 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fnip2Q80TD3 1108 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc41a2Q8BYR8 573 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Appl1Q8K3H0 707 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oas1dQ8VI95 361 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 TrioQ0KL02 3102 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dthd1E9PZX1 795 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abhd12bG3UZN6 359 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ring1O35730 406 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ess2O70279 479 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rag1P15919 1040 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sstr1P30873 391 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plk2P53351 682 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grb7Q03160 535 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam47cQ14BE7 430 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bfsp2Q6NVD9 416 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xylt1Q811B1 953 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ano4Q8C5H1 955 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ogfod2Q9CQ04 349 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 CenpsQ9D084 142 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lysmd1Q9D0E3 226 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam227bQ9D518 532 aa12.04□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrriq4A6H6A4 596 aa12.03□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38 ms