RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 TOPBP1Q92547 1522 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 CDC45O75419 566 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 PSMA5P28066 241 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 HECW1Q76N89 1606 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.33■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 ERBINQ96RT1 1412 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 HIP1O00291 1037 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 GNAI2P04899 355 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 NUCB2P80303 420 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 ARAP1Q96P48 1450 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 SLC4A2P04920 1241 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 SYNJ1O43426 1573 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDP1-208ENST00000613122 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 MYL6BP14649 208 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 KDM4AO75164 1064 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 HMGXB3Q12766 1538 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 EPS15P42566 896 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF592Q92610 1267 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDP1-208ENST00000613122 OLFM4Q6UX06 510 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 BTBD11A6QL63 1104 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2B2Q01814 1243 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 GCC1Q96CN9 775 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 SIL1Q9H173 461 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 DAPK1P53355 1430 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 HOMER1Q86YM7 354 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 ODF2Q5BJF6 829 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 GPS2Q13227 327 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 TOP2BQ02880 1626 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 CD109Q6YHK3 1445 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2B1P20020 1258 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 SDF4Q9BRK5 362 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 GSE1Q14687 1217 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF428Q96B54 188 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.14■■□□□ 1.46
CTDP1-208ENST00000613122 OFD1O75665 1012 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 WDR63Q8IWG1 891 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 TXLNAP40222 546 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 STARD3NLO95772 234 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 PDE3AQ14432 1141 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDP1-208ENST00000613122 NEK4P51957 841 aa24.1■■□□□ 1.45
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