RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
FCHO1-227ENST00000598960 C14orf37Q86TY3 774 aa19.03■□□□□ 0.64
FCHO1-227ENST00000598960 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.02■□□□□ 0.64
FCHO1-227ENST00000598960 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.64
FCHO1-227ENST00000598960 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.01■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.01■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
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FCHO1-227ENST00000598960 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
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FCHO1-227ENST00000598960 NME9Q86XW9 330 aa18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 MST1RQ04912 1400 aa18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
FCHO1-227ENST00000598960 MSH6P52701 1360 aa18.95■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.95■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.95■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 USP31Q70CQ4 1352 aa18.94■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.94■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 MTHFSP49914 203 aa18.93■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 COG3Q96JB2 828 aa18.93■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.93■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 ALS2Q96Q42 1657 aa18.92■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 PEAK1Q9H792 1746 aa18.92■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 CFAP53Q96M91 514 aa18.92■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 LTN1O94822 1766 aa18.91■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 ATF3P18847 181 aa18.9■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.9■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.9■□□□□ 0.62
FCHO1-227ENST00000598960 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.89■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 ORAI2Q96SN7 254 aa18.88■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.88■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.86■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 POLKQ9UBT6 870 aa18.86■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 SLIT3O75094 1523 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 NFAT5O94916 1531 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-227ENST00000598960 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.83■□□□□ 0.6
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FCHO1-227ENST00000598960 FOXO3O43524 673 aa18.8■□□□□ 0.6
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FCHO1-227ENST00000598960 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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FCHO1-227ENST00000598960 NUDCQ9Y266 331 aa18.79■□□□□ 0.6
FCHO1-227ENST00000598960 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
FCHO1-227ENST00000598960 SBNO1A3KN83 1393 aa18.78■□□□□ 0.6
FCHO1-227ENST00000598960 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.77■□□□□ 0.6
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.77■□□□□ 0.6
FCHO1-227ENST00000598960 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.77■□□□□ 0.6
FCHO1-227ENST00000598960 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 ABCA3Q99758 1704 aa18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 FLT4P35916 1363 aa18.76■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.75■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.75■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
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FCHO1-227ENST00000598960 USP19O94966 1318 aa18.74■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 BRINP3Q76B58 766 aa18.74■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 RUNDC1Q96C34 613 aa18.74■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.73■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 SOX12O15370 315 aa18.73■□□□□ 0.59
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FCHO1-227ENST00000598960 APAF1O14727 1248 aa18.71■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 PDE3BQ13370 1112 aa18.71■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 SLAIN2Q9P270 581 aa18.71■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF521Q96K83 1311 aa18.71■□□□□ 0.59
FCHO1-227ENST00000598960 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.7■□□□□ 0.58
FCHO1-227ENST00000598960 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
FCHO1-227ENST00000598960 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.69■□□□□ 0.58
FCHO1-227ENST00000598960 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
FCHO1-227ENST00000598960 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
FCHO1-227ENST00000598960 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.69■□□□□ 0.58
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGEF10O15013 1369 aa18.68■□□□□ 0.58
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