RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF14Q5TI25 921 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-208ENST00000597576 PEAK1Q9H792 1746 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-208ENST00000597576 DLC1Q96QB1 1528 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-208ENST00000597576 SBNO1A3KN83 1393 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 BTG4Q9NY30 223 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 TECPR2O15040 1411 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 SYT17Q9BSW7 474 aa11.56□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF10O15013 1369 aa11.55□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM2FA1L443 756 aa11.54□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.54□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.54□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.53□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 MAP3K5Q99683 1374 aa11.53□□□□□ -0.56
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.52□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB7AO95365 584 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 NUP155O75694 1391 aa11.5□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHG5O94827 1062 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.49□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PSME1Q06323 249 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.48□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.47□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PLSCR1O15162 318 aa11.47□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 SLC34A2O95436 690 aa11.47□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 HSPA6P17066 643 aa11.47□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 BARGINQ6ZT62 677 aa11.47□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 ABCC11Q96J66 1382 aa11.46□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PROM2Q8N271 834 aa11.46□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
ZNF548-208ENST00000597576 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.46□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC37A3O60309 1634 aa11.46□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 PAPPAQ13219 1627 aa11.46□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.43□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 AKAP12Q02952 1782 aa11.43□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 ATP7BP35670 1465 aa11.43□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.43□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 SSH2Q76I76 1423 aa11.43□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.42□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.42□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 PDE3BQ13370 1112 aa11.42□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.42□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 MTFR1LQ9H019 292 aa11.42□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0232Q92628 1395 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 ATP10DQ9P241 1426 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-208ENST00000597576 ADCY9O60503 1353 aa11.4□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 GPR162Q16538 588 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 ARXQ96QS3 562 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 BCL9O00512 1426 aa11.38□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 SLC15A2Q16348 729 aa11.38□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.38□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 STK26Q9P289 416 aa11.38□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 PRELPP51888 382 aa11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 CHRNA2Q15822 529 aa11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 SIRT1Q96EB6 747 aa11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 STRN4Q9NRL3 753 aa11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 USP35Q9P2H5 1018 aa11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 WDR90Q96KV7 1748 aa11.37□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.36□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 PIK3C2GO75747 1445 aa11.36□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.36□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.36□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.35□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 CAPN15O75808 1086 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 STK32BQ9NY57 414 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 ITSN1Q15811 1721 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-208ENST00000597576 NHSQ6T4R5 1651 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 TXNRD1Q16881 649 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms