RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM94Q12767 1356 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 USP31Q70CQ4 1352 aa20.34■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-214ENST00000589769 MST1RQ04912 1400 aa20.33■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.33■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 NUTM2FA1L443 756 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 NME9Q86XW9 330 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 MTHFSP49914 203 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 CFAP53Q96M91 514 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 C14orf37Q86TY3 774 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 COG3Q96JB2 828 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-214ENST00000589769 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 PEAK1Q9H792 1746 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 MSH6P52701 1360 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 ALS2Q96Q42 1657 aa20.24■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 POLKQ9UBT6 870 aa20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 SLIT3O75094 1523 aa20.21■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 NFAT5O94916 1531 aa20.21■□□□□ 0.83
EFTUD2-214ENST00000589769 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.2■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.2■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.19■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 ATF3P18847 181 aa20.18■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.18■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 NGEFQ8N5V2 710 aa20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 ORAI2Q96SN7 254 aa20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 PXDNQ92626 1479 aa20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 LTN1O94822 1766 aa20.16■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.15■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.15■□□□□ 0.82
EFTUD2-214ENST00000589769 SBNO1A3KN83 1393 aa20.14■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 RTL1A6NKG5 1358 aa20.14■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF521Q96K83 1311 aa20.14■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 PDE3BQ13370 1112 aa20.14■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 NUDCQ9Y266 331 aa20.14■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.13■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 FLT4P35916 1363 aa20.12■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 USP19O94966 1318 aa20.11■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 RUNDC1Q96C34 613 aa20.11■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 FBLN1P23142 703 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 IL13P35225 146 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 NLRP6P59044 892 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 PSME1Q06323 249 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.09■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.08■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 ABTB2Q8N961 1025 aa20.08■□□□□ 0.81
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCC6O95255 1503 aa20.07■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 FOXO3O43524 673 aa20.07■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.06■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 APAF1O14727 1248 aa20.05■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.05■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 ARHGEF10O15013 1369 aa20.05■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.04■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCA3Q99758 1704 aa20.04■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 FCHSD2O94868 740 aa20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC27Q2M243 656 aa20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 BRINP3Q76B58 766 aa20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.02■□□□□ 0.8
EFTUD2-214ENST00000589769 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.01■□□□□ 0.79
EFTUD2-214ENST00000589769 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
EFTUD2-214ENST00000589769 KDRP35968 1356 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms