RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 ABTB2Q8N961 1025 aa26.61■■□□□ 1.85
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GIPC1-210ENST00000589497 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-210ENST00000589497 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-210ENST00000589497 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-210ENST00000589497 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-210ENST00000589497 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.58■■□□□ 1.85
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
GIPC1-210ENST00000589497 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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GIPC1-210ENST00000589497 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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GIPC1-210ENST00000589497 ALS2Q96Q42 1657 aa26.52■■□□□ 1.84
GIPC1-210ENST00000589497 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
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GIPC1-210ENST00000589497 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.49■■□□□ 1.83
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GIPC1-210ENST00000589497 ATRNO75882 1429 aa26.46■■□□□ 1.83
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GIPC1-210ENST00000589497 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-210ENST00000589497 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.43■■□□□ 1.82
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GIPC1-210ENST00000589497 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.41■■□□□ 1.82
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GIPC1-210ENST00000589497 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.32■■□□□ 1.8
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GIPC1-210ENST00000589497 CPDO75976 1380 aa26.31■■□□□ 1.8
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GIPC1-210ENST00000589497 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.29■■□□□ 1.8
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GIPC1-210ENST00000589497 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.26■■□□□ 1.79
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GIPC1-210ENST00000589497 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-210ENST00000589497 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-210ENST00000589497 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-210ENST00000589497 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-210ENST00000589497 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-210ENST00000589497 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
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