RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-215	ENST00000589485	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
ILF3-215	ENST00000589485	CABP1	Q9NZU7	370 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ILF3-215	ENST00000589485	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ILF3-215	ENST00000589485	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ILF3-215	ENST00000589485	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
ILF3-215	ENST00000589485	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		29.24	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	ATRN	O75882	1429 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	SLIT2	O94813	1529 aa		29.21	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	ABTB2	Q8N961	1025 aa		29.21	■■■□□ 2.27
ILF3-215	ENST00000589485	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	AKAP12	Q02952	1782 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	USP6	P35125	1406 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	FAM83G	A6ND36	823 aa		29.16	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	RGS12	O14924	1447 aa		29.16	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	USP47	Q96K76	1375 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
ILF3-215	ENST00000589485	SLC24A1	O60721	1099 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	NLRP13	Q86W25	1043 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	TMC1	Q8TDI8	760 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		29.12	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	TESK2	Q96S53	571 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	BTG4	Q9NY30	223 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	KIAA0232	Q92628	1395 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	NRAP	Q86VF7	1730 aa		29.08	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.08	■■■□□ 2.25
ILF3-215	ENST00000589485	PIK3C2A	O00443	1686 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	USP19	O94966	1318 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	NLRP6	P59044	892 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	VPS72	Q15906	364 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	SSH2	Q76I76	1423 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	GLI3	P10071	1580 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	CHRNA2	Q15822	529 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	TMF1	P82094	1093 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	GC	P02774	474 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ILF3-215	ENST00000589485	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		29.01	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		29	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	SLIT3	O75094	1523 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	CPD	O75976	1380 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	STRN4	Q9NRL3	753 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ILF3-215	ENST00000589485	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.95	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485		A0A1W2PP64	1363 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	EVA1C	P58658	441 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	CDCA8	Q53HL2	280 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485		A0A0G2JS52	829 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	MYT1	Q01538	1121 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	SOX12	O15370	315 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	NME9	Q86XW9	330 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ILF3-215	ENST00000589485	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	NFAT5	O94916	1531 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	COL18A1	P39060	1754 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ILF3-215	ENST00000589485	RGPD5	Q99666	1765 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ILF3-215	ENST00000589485	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ILF3-215	ENST00000589485	MYOM1	P52179	1685 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ILF3-215	ENST00000589485	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.8	■■■□□ 2.2

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