RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585313.5

IFT20-215, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

APPRIS P4 TSL 3 BASIC

Gene IFT20, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-215ENST00000585313 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.22■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 NUTM2FA1L443 756 aa22.22■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.22■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 CFAP53Q96M91 514 aa22.21■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 PIK3C2AO00443 1686 aa22.2■■□□□ 1.15
IFT20-215ENST00000585313 C14orf37Q86TY3 774 aa22.2■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.2■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.2■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.2■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 TMEM94Q12767 1356 aa22.18■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 MTHFSP49914 203 aa22.18■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 NME9Q86XW9 330 aa22.18■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.18■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 COG3Q96JB2 828 aa22.17■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.17■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.16■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 USP31Q70CQ4 1352 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.14■■□□□ 1.14
IFT20-215ENST00000585313 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.14■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.14■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 MST1RQ04912 1400 aa22.12■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 MSH6P52701 1360 aa22.11■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 ATF3P18847 181 aa22.09■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.08■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.08■■□□□ 1.13
IFT20-215ENST00000585313 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.07■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 POLKQ9UBT6 870 aa22.07■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 NGEFQ8N5V2 710 aa22.06■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 NUDCQ9Y266 331 aa22.06■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 PEAK1Q9H792 1746 aa22.04■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.03■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 PDE3BQ13370 1112 aa22.03■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 ALS2Q96Q42 1657 aa22.03■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
IFT20-215ENST00000585313 PSME1Q06323 249 aa22.01■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 ORAI2Q96SN7 254 aa22.01■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.99■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 LTN1O94822 1766 aa21.99■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 RUNDC1Q96C34 613 aa21.99■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 SLIT3O75094 1523 aa21.98■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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IFT20-215ENST00000585313 NFAT5O94916 1531 aa21.97■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 NLRP6P59044 892 aa21.97■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.113e-7■■■■■ 27.9
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IFT20-215ENST00000585313 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.96■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 SBNO1A3KN83 1393 aa21.96■■□□□ 1.11
IFT20-215ENST00000585313 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 FBLN1P23142 703 aa21.95■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 FLT4P35916 1363 aa21.95■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 FOXO3O43524 673 aa21.94■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 ZNF521Q96K83 1311 aa21.94■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 RTL1A6NKG5 1358 aa21.94■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 APAF1O14727 1248 aa21.93■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 IL13P35225 146 aa21.93■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.93■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.93■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 PXDNQ92626 1479 aa21.92■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.92■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.91■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.91■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 USP19O94966 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 FCHSD2O94868 740 aa21.9■■□□□ 1.1
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IFT20-215ENST00000585313 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.89■■□□□ 1.1
IFT20-215ENST00000585313 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.89■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.89■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.89■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 CCDC27Q2M243 656 aa21.88■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.88■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.87■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.87■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.87■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.86■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 ARHGEF10O15013 1369 aa21.86■■□□□ 1.09
IFT20-215ENST00000585313 AMPHP49418 695 aa21.85■■□□□ 1.09
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