RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.77■□□□□ 0.28
GGA3-217ENST00000583667 RGL3Q3MIN7 710 aa16.77■□□□□ 0.28
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GGA3-217ENST00000583667 PSME1Q06323 249 aa16.76■□□□□ 0.27
GGA3-217ENST00000583667 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.76■□□□□ 0.27
GGA3-217ENST00000583667 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
GGA3-217ENST00000583667 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.75■□□□□ 0.27
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GGA3-217ENST00000583667 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.74■□□□□ 0.27
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GGA3-217ENST00000583667 RREB1Q92766 1687 aa16.74■□□□□ 0.27
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GGA3-217ENST00000583667 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.72■□□□□ 0.27
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GGA3-217ENST00000583667 MAP3K5Q99683 1374 aa16.47■□□□□ 0.23
GGA3-217ENST00000583667 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.47■□□□□ 0.23
GGA3-217ENST00000583667 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.47■□□□□ 0.23
GGA3-217ENST00000583667 SSH2Q76I76 1423 aa16.46■□□□□ 0.23
GGA3-217ENST00000583667 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
GGA3-217ENST00000583667 CDCA8Q53HL2 280 aa16.46■□□□□ 0.23
GGA3-217ENST00000583667 STK32BQ9NY57 414 aa16.46■□□□□ 0.23
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