RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
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RAB40C-211ENST00000568586 EVC2Q86UK5 1308 aa41.93■■■■■ 4.3
RAB40C-211ENST00000568586 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.92■■■■■ 4.3
RAB40C-211ENST00000568586 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
RAB40C-211ENST00000568586 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa41.88■■■■■ 4.3
RAB40C-211ENST00000568586 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.88■■■■■ 4.29
RAB40C-211ENST00000568586 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.87■■■■■ 4.29
RAB40C-211ENST00000568586 FAM83GA6ND36 823 aa41.87■■■■■ 4.29
RAB40C-211ENST00000568586 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
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RAB40C-211ENST00000568586 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
RAB40C-211ENST00000568586 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.83■■■■■ 4.29
RAB40C-211ENST00000568586 CABP1Q9NZU7 370 aa41.83■■■■■ 4.29
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RAB40C-211ENST00000568586 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.76■■■■■ 4.28
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RAB40C-211ENST00000568586 ABTB2Q8N961 1025 aa41.73■■■■■ 4.27
RAB40C-211ENST00000568586 SSH2Q76I76 1423 aa41.72■■■■■ 4.27
RAB40C-211ENST00000568586 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.72■■■■■ 4.27
RAB40C-211ENST00000568586 USP19O94966 1318 aa41.7■■■■■ 4.27
RAB40C-211ENST00000568586 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.27
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RAB40C-211ENST00000568586 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.69■■■■■ 4.26
RAB40C-211ENST00000568586 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.68■■■■■ 4.26
RAB40C-211ENST00000568586 NRAPQ86VF7 1730 aa41.68■■■■■ 4.26
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RAB40C-211ENST00000568586 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
RAB40C-211ENST00000568586 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.66■■■■■ 4.26
RAB40C-211ENST00000568586 KIAA0232Q92628 1395 aa41.65■■■■■ 4.26
RAB40C-211ENST00000568586 NLRP13Q86W25 1043 aa41.65■■■■■ 4.26
RAB40C-211ENST00000568586 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
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RAB40C-211ENST00000568586 CPDO75976 1380 aa41.61■■■■■ 4.25
RAB40C-211ENST00000568586 NRKQ7Z2Y5 1582 aa41.6■■■■■ 4.25
RAB40C-211ENST00000568586 TESK2Q96S53 571 aa41.59■■■■■ 4.25
RAB40C-211ENST00000568586 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
RAB40C-211ENST00000568586 EP400Q96L91 3159 aa41.58■■■■■ 4.25
RAB40C-211ENST00000568586 GCP02774 474 aa41.57■■■■■ 4.25
RAB40C-211ENST00000568586 AKAP12Q02952 1782 aa41.56■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.54■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa41.54■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 SLC24A1O60721 1099 aa41.54■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa41.53■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41.53■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 CHRNA2Q15822 529 aa41.53■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.53■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 NLRP6P59044 892 aa41.52■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 TTC21AQ8NDW8 1320 aa41.51■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 SLIT3O75094 1523 aa41.51■■■■■ 4.24
RAB40C-211ENST00000568586 PIK3C2AO00443 1686 aa41.5■■■■■ 4.23
RAB40C-211ENST00000568586 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.49■■■■■ 4.23
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RAB40C-211ENST00000568586 MON2Q7Z3U7 1717 aa41.44■■■■■ 4.22
RAB40C-211ENST00000568586 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.43■■■■■ 4.22
RAB40C-211ENST00000568586 USP47Q96K76 1375 aa41.42■■■■■ 4.22
RAB40C-211ENST00000568586 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
RAB40C-211ENST00000568586 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa41.42■■■■■ 4.22
RAB40C-211ENST00000568586 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa41.42■■■■■ 4.22
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC125Q86Z20 511 aa41.41■■■■■ 4.22
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RAB40C-211ENST00000568586 NINLQ9Y2I6 1382 aa41.37■■■■■ 4.21
RAB40C-211ENST00000568586 KRT27Q7Z3Y8 459 aa41.37■■■■■ 4.21
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RAB40C-211ENST00000568586 TERF2IPQ9NYB0 399 aa41.35■■■■■ 4.21
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RAB40C-211ENST00000568586 USP54Q70EL1 1684 aa41.29■■■■■ 4.2
RAB40C-211ENST00000568586 COL18A1P39060 1754 aa41.27■■■■■ 4.2
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RAB40C-211ENST00000568586 A0A0G2JS52 829 aa41.26■■■■■ 4.2
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RAB40C-211ENST00000568586 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.23■■■■■ 4.19
RAB40C-211ENST00000568586 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
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RAB40C-211ENST00000568586 AXIN2Q9Y2T1 843 aa41.21■■■■■ 4.19
RAB40C-211ENST00000568586 CRB1P82279 1406 aa41.19■■■■■ 4.18
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