RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.05■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.03■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.03■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.03■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
INO80E-212ENST00000568043 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27■■□□□ 1.91
INO80E-212ENST00000568043 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27■■□□□ 1.91
INO80E-212ENST00000568043 DISP2A7MBM2 1401 aa26.97■■□□□ 1.91
INO80E-212ENST00000568043 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
INO80E-212ENST00000568043 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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INO80E-212ENST00000568043 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.93■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
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INO80E-212ENST00000568043 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.9■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 ATP7BP35670 1465 aa26.89■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.89■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 ITSN1Q15811 1721 aa26.89■■□□□ 1.9
INO80E-212ENST00000568043 TRIM37O94972 964 aa26.87■■□□□ 1.89
INO80E-212ENST00000568043 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.86■■□□□ 1.89
INO80E-212ENST00000568043 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.85■■□□□ 1.89
INO80E-212ENST00000568043 STRN4Q9NRL3 753 aa26.85■■□□□ 1.89
INO80E-212ENST00000568043 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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INO80E-212ENST00000568043 RREB1Q92766 1687 aa26.82■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.8■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.8■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 USP35Q9P2H5 1018 aa26.8■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.79■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 APBA3O96018 575 aa26.79■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.77■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 SSH2Q76I76 1423 aa26.77■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 BARGINQ6ZT62 677 aa26.77■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 CDK19Q9BWU1 502 aa26.77■■□□□ 1.88
INO80E-212ENST00000568043 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.76■■□□□ 1.87
INO80E-212ENST00000568043 ACEP12821 1306 aa26.75■■□□□ 1.87
INO80E-212ENST00000568043 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.75■■□□□ 1.87
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INO80E-212ENST00000568043 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.7■■□□□ 1.86
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INO80E-212ENST00000568043 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
INO80E-212ENST00000568043 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.63■■□□□ 1.85
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INO80E-212ENST00000568043 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.6■■□□□ 1.85
INO80E-212ENST00000568043 NBPF14Q5TI25 921 aa26.6■■□□□ 1.85
INO80E-212ENST00000568043 YY1P25490 414 aa26.58■■□□□ 1.85
INO80E-212ENST00000568043 NLRP13Q86W25 1043 aa26.58■■□□□ 1.85
INO80E-212ENST00000568043 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.57■■□□□ 1.84
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INO80E-212ENST00000568043 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 COL18A1P39060 1754 aa26.56■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.56■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 CRB1P82279 1406 aa26.56■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 KCNQ2O43526 872 aa26.55■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.55■■□□□ 1.84
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INO80E-212ENST00000568043 CABP2Q9NPB3 220 aa26.54■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 CASZ1Q86V15 1759 aa26.53■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.52■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.52■■□□□ 1.84
INO80E-212ENST00000568043 SLIT3O75094 1523 aa26.52■■□□□ 1.84
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INO80E-212ENST00000568043 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.52■■□□□ 1.84
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INO80E-212ENST00000568043 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 RGPD5Q99666 1765 aa26.5■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.5■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 USP6P35125 1406 aa26.49■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.49■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.48■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 PIK3C2AO00443 1686 aa26.48■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 PROM2Q8N271 834 aa26.48■■□□□ 1.83
INO80E-212ENST00000568043 CABP1Q9NZU7 370 aa26.48■■□□□ 1.83
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