RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567432.1

GINS3-208, Transcript of GINS complex subunit 3, human

TSL 3

Gene GINS3, Length 322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GINS3-208	ENST00000567432	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	GPR37L1	O60883	481 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	IRF5	Q13568	498 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	RPIA	P49247	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	PTK2	Q05397	1052 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	BAP1	Q92560	729 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432		A0A0G2JS52	829 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ZBBX	A8MT70	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	VAC14	Q08AM6	782 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	TRIM32	Q13049	653 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	NR1H3	Q13133	447 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	SLC19A1	P41440	591 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	SH3BP2	P78314	561 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GINS3-208	ENST00000567432	SOX11	P35716	441 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	WNT7B	P56706	349 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	AGER	Q15109	404 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	SKOR1	P84550	965 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ADAM32	Q8TC27	787 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ALG2	Q9H553	416 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	GLMN	Q92990	594 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	SPRYD7	Q5W111	196 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	WNT7A	O00755	349 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GINS3-208	ENST00000567432	FOXC1	Q12948	553 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	SIAH2	O43255	324 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	RGS20	O76081	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	MPND	Q8N594	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ARID3A	Q99856	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GINS3-208	ENST00000567432	ESPN	B1AK53	854 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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