RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.55■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 AKAP12Q02952 1782 aa23.55■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.55■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 MTHFSP49914 203 aa23.54■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 ITSN1Q15811 1721 aa23.54■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 STRCQ7RTU9 1775 aa23.54■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 NME9Q86XW9 330 aa23.53■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 USP6P35125 1406 aa23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.52■■□□□ 1.36
GDE1-203ENST00000564172 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.52■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 INSRP06213 1382 aa23.51■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.49■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 SSH2Q76I76 1423 aa23.49■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.48■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.48■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 TMEM94Q12767 1356 aa23.48■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 COG3Q96JB2 828 aa23.47■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.47■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 CFAP53Q96M91 514 aa23.46■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.46■■□□□ 1.35
GDE1-203ENST00000564172 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.45■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.44■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.44■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.44■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 FBLN1P23142 703 aa23.43■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.42■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 POLKQ9UBT6 870 aa23.41■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.4■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 ORAI2Q96SN7 254 aa23.4■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
GDE1-203ENST00000564172 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.39■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.39■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 ATF3P18847 181 aa23.38■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.38■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.37■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.37■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 DCCP43146 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 SHPRHQ149N8 1683 aa23.37■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.36■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.35■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 USP31Q70CQ4 1352 aa23.35■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 PSME1Q06323 249 aa23.34■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.34■■□□□ 1.33
GDE1-203ENST00000564172 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.34■■□□□ 1.33
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GDE1-203ENST00000564172 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
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GDE1-203ENST00000564172 MSH6P52701 1360 aa23.33■■□□□ 1.32
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GDE1-203ENST00000564172 FOXO3O43524 673 aa23.32■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 NLRP6P59044 892 aa23.32■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 ABTB2Q8N961 1025 aa23.31■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 PIK3C2AO00443 1686 aa23.3■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 APAF1O14727 1248 aa23.28■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.28■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GDE1-203ENST00000564172 SOX12O15370 315 aa23.26■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 RUNDC1Q96C34 613 aa23.26■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 PDE3BQ13370 1112 aa23.25■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 FKBP8Q14318 412 aa23.25■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.24■■□□□ 1.31
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GDE1-203ENST00000564172 IL13P35225 146 aa23.23■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.22■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 NGEFQ8N5V2 710 aa23.21■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 USP54Q70EL1 1684 aa23.21■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 ZNF521Q96K83 1311 aa23.21■■□□□ 1.31
GDE1-203ENST00000564172 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.2■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.2■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.19■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 FCHSD2O94868 740 aa23.18■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.18■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 SLAIN2Q9P270 581 aa23.17■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 SBNO1A3KN83 1393 aa23.17■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.16■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.16■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 PEAK1Q9H792 1746 aa23.16■■□□□ 1.3
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