RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
CMTM4-204ENST00000563952 BCL9LQ86UU0 1499 aa43.62■■■■■ 4.57
CMTM4-204ENST00000563952 CABP1Q9NZU7 370 aa43.61■■■■■ 4.57
CMTM4-204ENST00000563952 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
CMTM4-204ENST00000563952 ATRNO75882 1429 aa43.59■■■■■ 4.57
CMTM4-204ENST00000563952 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.59■■■■■ 4.57
CMTM4-204ENST00000563952 SLIT2O94813 1529 aa43.57■■■■■ 4.56
CMTM4-204ENST00000563952 NUTM2GQ5VZR2 741 aa43.55■■■■■ 4.56
CMTM4-204ENST00000563952 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa43.54■■■■■ 4.56
CMTM4-204ENST00000563952 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa43.54■■■■■ 4.56
CMTM4-204ENST00000563952 PLCH1Q4KWH8 1693 aa43.53■■■■■ 4.56
CMTM4-204ENST00000563952 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
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CMTM4-204ENST00000563952 UNC5CLQ8IV45 518 aa43.52■■■■■ 4.56
CMTM4-204ENST00000563952 FAM83GA6ND36 823 aa43.49■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 ABTB2Q8N961 1025 aa43.48■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 ATAD2Q6PL18 1390 aa43.47■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 NWD2Q9ULI1 1742 aa43.46■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa43.45■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 USP6P35125 1406 aa43.45■■■■■ 4.55
CMTM4-204ENST00000563952 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
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CMTM4-204ENST00000563952 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
CMTM4-204ENST00000563952 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa43.4■■■■■ 4.54
CMTM4-204ENST00000563952 PRDM11Q9NQV5 511 aa43.38■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 AKAP12Q02952 1782 aa43.37■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 BTG4Q9NY30 223 aa43.36■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA0232Q92628 1395 aa43.35■■■■■ 4.53
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CMTM4-204ENST00000563952 VPS72Q15906 364 aa43.34■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 NLRP13Q86W25 1043 aa43.34■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
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CMTM4-204ENST00000563952 USP47Q96K76 1375 aa43.32■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 TESK2Q96S53 571 aa43.32■■■■■ 4.53
CMTM4-204ENST00000563952 NRKQ7Z2Y5 1582 aa43.32■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 SSH2Q76I76 1423 aa43.31■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 USP19O94966 1318 aa43.31■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 TMC1Q8TDI8 760 aa43.31■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 CHRNA2Q15822 529 aa43.29■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 NLRP6P59044 892 aa43.28■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 PIK3C2AO00443 1686 aa43.27■■■■■ 4.52
CMTM4-204ENST00000563952 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa43.25■■■■■ 4.51
CMTM4-204ENST00000563952 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP43.25■■■■■ 4.51
CMTM4-204ENST00000563952 MON2Q7Z3U7 1717 aa43.23■■■■■ 4.51
CMTM4-204ENST00000563952 GCP02774 474 aa43.23■■■■■ 4.51
CMTM4-204ENST00000563952 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa43.22■■■■■ 4.51
CMTM4-204ENST00000563952 SLC24A1O60721 1099 aa43.21■■■■■ 4.51
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CMTM4-204ENST00000563952 CD163L1Q9NR16 1453 aa43.19■■■■■ 4.51
CMTM4-204ENST00000563952 TTC21AQ8NDW8 1320 aa43.19■■■■■ 4.5
CMTM4-204ENST00000563952 CPDO75976 1380 aa43.17■■■■■ 4.5
CMTM4-204ENST00000563952 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
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CMTM4-204ENST00000563952 STRN4Q9NRL3 753 aa43.15■■■■■ 4.5
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CMTM4-204ENST00000563952 SEPT12Q8IYM1 358 aa43.13■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 TERF2IPQ9NYB0 399 aa43.13■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa43.1■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa43.1■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 BRWD3Q6RI45 1802 aa43.09■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 A0A1W2PP64 1363 aa43.09■■■■■ 4.49
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CMTM4-204ENST00000563952 MYT1Q01538 1121 aa43.09■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 LMO7Q8WWI1 1683 aa43.08■■■■■ 4.49
CMTM4-204ENST00000563952 EVA1CP58658 441 aa43.08■■■■■ 4.49
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CMTM4-204ENST00000563952 NME9Q86XW9 330 aa43.03■■■■■ 4.48
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CMTM4-204ENST00000563952 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa43■■■■■ 4.47
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CMTM4-204ENST00000563952 ARHGEF25Q86VW2 580 aa42.92■■■■■ 4.46
CMTM4-204ENST00000563952 COL18A1P39060 1754 aa42.92■■■■■ 4.46
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CMTM4-204ENST00000563952 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa42.91■■■■■ 4.46
CMTM4-204ENST00000563952 AXIN2Q9Y2T1 843 aa42.87■■■■■ 4.45
CMTM4-204ENST00000563952 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
CMTM4-204ENST00000563952 TCP11L2Q8N4U5 519 aa42.84■■■■■ 4.45
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