RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, human

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFGE8-208	ENST00000558773	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	NRAP	Q86VF7	1730 aa		29	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		29	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		29	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	BTG4	Q9NY30	223 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	ACE	P12821	1306 aa		28.97	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.97	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.23
MFGE8-208	ENST00000558773	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MFGE8-208	ENST00000558773	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
MFGE8-208	ENST00000558773	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MFGE8-208	ENST00000558773	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MFGE8-208	ENST00000558773	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
MFGE8-208	ENST00000558773	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.89	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.89	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MFGE8-208	ENST00000558773	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	USP19	O94966	1318 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773		A0A0G2JS52	829 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	MYT1	Q01538	1121 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	CABP1	Q9NZU7	370 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	CPD	O75976	1380 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	NLRP13	Q86W25	1043 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MFGE8-208	ENST00000558773	EVC2	Q86UK5	1308 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	STRN4	Q9NRL3	753 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	USP6	P35125	1406 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	GC	P02774	474 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	SSH2	Q76I76	1423 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MFGE8-208	ENST00000558773	EVA1C	P58658	441 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	FAM182B	Q5T319	152 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	BAG6	P46379	1132 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	NLRP6	P59044	892 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	SLIT3	O75094	1523 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MFGE8-208	ENST00000558773	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	AKAP12	Q02952	1782 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	DISP2	A7MBM2	1401 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MFGE8-208	ENST00000558773	COL18A1	P39060	1754 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	CRB1	P82279	1406 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	TRIM37	O94972	964 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.16
MFGE8-208	ENST00000558773	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	APBA3	O96018	575 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	NFAT5	O94916	1531 aa		28.45	■■■□□ 2.15
MFGE8-208	ENST00000558773	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		28.45	■■■□□ 2.14

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