RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557484.5

GABRA5-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, human

TSL 5

Gene GABRA5, Length 506 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRA5-211	ENST00000557484	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		43.46	■■■■■ 4.55
GABRA5-211	ENST00000557484	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		43.46	■■■■■ 4.55
GABRA5-211	ENST00000557484	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		43.45	■■■■■ 4.55
GABRA5-211	ENST00000557484	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		43.45	■■■■■ 4.55
GABRA5-211	ENST00000557484	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	43.44	■■■■■ 4.54
GABRA5-211	ENST00000557484	ATRN	O75882	1429 aa		43.44	■■■■■ 4.54
GABRA5-211	ENST00000557484	SLIT2	O94813	1529 aa		43.43	■■■■■ 4.54
GABRA5-211	ENST00000557484	ABCA3	Q99758	1704 aa		43.42	■■■■■ 4.54
GABRA5-211	ENST00000557484	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		43.41	■■■■■ 4.54
GABRA5-211	ENST00000557484	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
GABRA5-211	ENST00000557484	CABP1	Q9NZU7	370 aa		43.37	■■■■■ 4.53
GABRA5-211	ENST00000557484	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		43.32	■■■■■ 4.53
GABRA5-211	ENST00000557484	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		43.32	■■■■■ 4.53
GABRA5-211	ENST00000557484	SLC24A1	O60721	1099 aa		43.32	■■■■■ 4.53
GABRA5-211	ENST00000557484	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
GABRA5-211	ENST00000557484	FAM83G	A6ND36	823 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	PLEKHG5	O94827	1062 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	RGS12	O14924	1447 aa		43.29	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	ABTB2	Q8N961	1025 aa		43.28	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		43.28	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
GABRA5-211	ENST00000557484	USP6	P35125	1406 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GABRA5-211	ENST00000557484	VPS72	Q15906	364 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GABRA5-211	ENST00000557484	NLRP13	Q86W25	1043 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GABRA5-211	ENST00000557484	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		43.23	■■■■■ 4.51
GABRA5-211	ENST00000557484	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
GABRA5-211	ENST00000557484	SSH2	Q76I76	1423 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	USP19	O94966	1318 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		43.16	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	BTG4	Q9NY30	223 aa		43.16	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	43.15	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
GABRA5-211	ENST00000557484	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		43.13	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	TESK2	Q96S53	571 aa		43.11	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	KIAA0232	Q92628	1395 aa		43.11	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	43.1	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	GLI3	P10071	1580 aa		43.1	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	AKAP12	Q02952	1782 aa		43.1	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		43.09	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	CPD	O75976	1380 aa		43.08	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	GC	P02774	474 aa		43.08	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	NRAP	Q86VF7	1730 aa		43.08	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	NLRP6	P59044	892 aa		43.07	■■■■■ 4.49
GABRA5-211	ENST00000557484	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		43.06	■■■■■ 4.48
GABRA5-211	ENST00000557484	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
GABRA5-211	ENST00000557484	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
GABRA5-211	ENST00000557484	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	43.04	■■■■■ 4.48
GABRA5-211	ENST00000557484	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		43.02	■■■■■ 4.48
GABRA5-211	ENST00000557484	USP47	Q96K76	1375 aa		43.01	■■■■■ 4.48
GABRA5-211	ENST00000557484	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		43	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	TMC1	Q8TDI8	760 aa		42.99	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	CHRNA2	Q15822	529 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	SLIT3	O75094	1523 aa		42.97	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		42.97	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		42.97	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		42.96	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	PIK3C2A	O00443	1686 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GABRA5-211	ENST00000557484	TMF1	P82094	1093 aa		42.94	■■■■■ 4.46
GABRA5-211	ENST00000557484	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		42.94	■■■■■ 4.46
GABRA5-211	ENST00000557484	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		42.93	■■■■■ 4.46
GABRA5-211	ENST00000557484	EVA1C	P58658	441 aa		42.9	■■■■■ 4.46
GABRA5-211	ENST00000557484	CDCA8	Q53HL2	280 aa		42.89	■■■■■ 4.46
GABRA5-211	ENST00000557484	CCDC125	Q86Z20	511 aa		42.89	■■■■■ 4.46
GABRA5-211	ENST00000557484	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	USP31	Q70CQ4	1352 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	STRN4	Q9NRL3	753 aa		42.84	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GABRA5-211	ENST00000557484		A0A1W2PP64	1363 aa		42.81	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		42.81	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	42.81	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	USP54	Q70EL1	1684 aa		42.77	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484		A0A0G2JS52	829 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	MYT1	Q01538	1121 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GABRA5-211	ENST00000557484	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	NME9	Q86XW9	330 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	COL18A1	P39060	1754 aa		42.71	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		42.7	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		42.7	■■■■■ 4.43
GABRA5-211	ENST00000557484	EP400	Q96L91	3159 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GABRA5-211	ENST00000557484	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GABRA5-211	ENST00000557484	NFAT5	O94916	1531 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GABRA5-211	ENST00000557484	ABCC6	O95255	1503 aa		42.66	■■■■■ 4.42

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