RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551901.5

RRN3P1-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RRN3P1, Length 1,157 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-204ENST00000551901 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.84□□□□□ -0.03
RRN3P1-204ENST00000551901 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.83□□□□□ -0.03
RRN3P1-204ENST00000551901 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
RRN3P1-204ENST00000551901 USP21Q9UK80 565 aa14.83□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.83□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 SLIT2O94813 1529 aa14.82□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.82□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 EVC2Q86UK5 1308 aa14.82□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 ATRNO75882 1429 aa14.82□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.82□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.81□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 CABP1Q9NZU7 370 aa14.8□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM83GA6ND36 823 aa14.78□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.78□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.78□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 SSH2Q76I76 1423 aa14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1-204ENST00000551901 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 RGS12O14924 1447 aa14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 PLEKHG5O94827 1062 aa14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 TESK2Q96S53 571 aa14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 USP6P35125 1406 aa14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 AKAP12Q02952 1782 aa14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 GLI3P10071 1580 aa14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 USP19O94966 1318 aa14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 NRAPQ86VF7 1730 aa14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 ABTB2Q8N961 1025 aa14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 ZBTB22O15209 634 aa14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 VPS72Q15906 364 aa14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 NLRP13Q86W25 1043 aa14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1-204ENST00000551901 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.7□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 BTG4Q9NY30 223 aa14.7□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 PIK3C2AO00443 1686 aa14.7□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 KIAA0232Q92628 1395 aa14.7□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC24A1O60721 1099 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 GCP02774 474 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 CPDO75976 1380 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 USP47Q96K76 1375 aa14.69□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 SLIT3O75094 1523 aa14.68□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.68□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 NLRP6P59044 892 aa14.67□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.66□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.66□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 CHRNA2Q15822 529 aa14.66□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1-204ENST00000551901 MSH5O43196 834 aa14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TMC1Q8TDI8 760 aa14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 USP54Q70EL1 1684 aa14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 USP31Q70CQ4 1352 aa14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 COL18A1P39060 1754 aa14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 A0A1W2PP64 1363 aa14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TMF1P82094 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.6□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.6□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.6□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.6□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 NFAT5O94916 1531 aa14.6□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.59□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 NME9Q86XW9 330 aa14.59□□□□□ -0.07
RRN3P1-204ENST00000551901 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RRN3P1-204ENST00000551901 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RRN3P1-204ENST00000551901 STRN4Q9NRL3 753 aa14.58□□□□□ -0.08
RRN3P1-204ENST00000551901 EVA1CP58658 441 aa14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1-204ENST00000551901 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1-204ENST00000551901 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms