RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 ADGRB1O14514 1584 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 ADGRB2O60241 1585 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 HRCP23327 699 aa23.75■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.75■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 CHRNA2Q15822 529 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 LRP5O75197 1615 aa23.73■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.73■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.73■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 STRN4Q9NRL3 753 aa23.72■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.72■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.7■■□□□ 1.39
CS-227ENST00000551441 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 KIAA0232Q92628 1395 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 USP35Q9P2H5 1018 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 TRIM37O94972 964 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.64■■□□□ 1.38
CS-227ENST00000551441 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 ATP7BP35670 1465 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 CDK19Q9BWU1 502 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 ITSN1Q15811 1721 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 APBA3O96018 575 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 EVA1CP58658 441 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-227ENST00000551441 ACEP12821 1306 aa23.58■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 DISP2A7MBM2 1401 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 PDE3BQ13370 1112 aa23.54■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 ABTB2Q8N961 1025 aa23.54■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 SSH2Q76I76 1423 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-227ENST00000551441 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.51■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.51■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.49■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 BARGINQ6ZT62 677 aa23.48■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 STAC3Q96MF2 364 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 RREB1Q92766 1687 aa23.46■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 CABP2Q9NPB3 220 aa23.46■■□□□ 1.35
CS-227ENST00000551441 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.45■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 USP19O94966 1318 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 GCP02774 474 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 NBPF14Q5TI25 921 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 NLRP13Q86W25 1043 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 CPDO75976 1380 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CS-227ENST00000551441 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 NLRP6P59044 892 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 CABP1Q9NZU7 370 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 YY1P25490 414 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 CRB1P82279 1406 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 SOX12O15370 315 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-227ENST00000551441 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 SPON1Q9HCB6 807 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 SBF2Q86WG5 1849 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 PEAK1Q9H792 1746 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 KCNQ2O43526 872 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 DDB1Q16531 1140 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 LRRC37A3O60309 1634 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 USP6P35125 1406 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 PIK3C2AO00443 1686 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 RGPD5Q99666 1765 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms