RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 TESK2Q96S53 571 aa27.12■■□□□ 1.93
SLC25A3-211ENST00000548847 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.11■■□□□ 1.93
SLC25A3-211ENST00000548847 PLEKHG5O94827 1062 aa27.11■■□□□ 1.93
SLC25A3-211ENST00000548847 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.09■■□□□ 1.93
SLC25A3-211ENST00000548847 USP47Q96K76 1375 aa27.09■■□□□ 1.93
SLC25A3-211ENST00000548847 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.08■■□□□ 1.93
SLC25A3-211ENST00000548847 USP6P35125 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 USP21Q9UK80 565 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 SLIT2O94813 1529 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 SSH2Q76I76 1423 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 AKAP12Q02952 1782 aa27.05■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 ATRNO75882 1429 aa27.03■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.03■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 RXRBP28702 533 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SLC25A3-211ENST00000548847 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.01■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 CD163L1Q9NR16 1453 aa27■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 ABTB2Q8N961 1025 aa27■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.99■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 FAM83GA6ND36 823 aa26.99■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.98■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.98■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 USP19O94966 1318 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 PIK3C2AO00443 1686 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC25A3-211ENST00000548847 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.95■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 RGS12O14924 1447 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC24A1O60721 1099 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 NRAPQ86VF7 1730 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 TMC1Q8TDI8 760 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 KIAA0232Q92628 1395 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 NLRP13Q86W25 1043 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 SLIT3O75094 1523 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 TMF1P82094 1093 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 GLI3P10071 1580 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 A0A1W2PP64 1363 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SLC25A3-211ENST00000548847 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 NLRP6P59044 892 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 BTG4Q9NY30 223 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 GCP02774 474 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 CPDO75976 1380 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 CHRNA2Q15822 529 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 VPS72Q15906 364 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC25A3-211ENST00000548847 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 USP54Q70EL1 1684 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 USP31Q70CQ4 1352 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 NME9Q86XW9 330 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 MYOM1P52179 1685 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 CDCA8Q53HL2 280 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 NFAT5O94916 1531 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 COL18A1P39060 1754 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 EP400Q96L91 3159 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 SOX12O15370 315 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 STRN4Q9NRL3 753 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.7■■□□□ 1.87
SLC25A3-211ENST00000548847 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC25A3-211ENST00000548847 EVA1CP58658 441 aa26.66■■□□□ 1.86
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