RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 ACEP12821 1306 aa35.53■■■■□ 3.28
TM7SF3-212ENST00000543088 PLEKHG5O94827 1062 aa35.52■■■■□ 3.28
TM7SF3-212ENST00000543088 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
TM7SF3-212ENST00000543088 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.49■■■■□ 3.27
TM7SF3-212ENST00000543088 ATRNO75882 1429 aa35.49■■■■□ 3.27
TM7SF3-212ENST00000543088 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.48■■■■□ 3.27
TM7SF3-212ENST00000543088 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.47■■■■□ 3.27
TM7SF3-212ENST00000543088 SLIT2O94813 1529 aa35.47■■■■□ 3.27
TM7SF3-212ENST00000543088 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 RGS12O14924 1447 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.42■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.39■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 CABP1Q9NZU7 370 aa35.39■■■■□ 3.26
TM7SF3-212ENST00000543088 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TM7SF3-212ENST00000543088 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.36■■■■□ 3.25
TM7SF3-212ENST00000543088 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TM7SF3-212ENST00000543088 ABTB2Q8N961 1025 aa35.34■■■■□ 3.25
TM7SF3-212ENST00000543088 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
TM7SF3-212ENST00000543088 USP6P35125 1406 aa35.33■■■■□ 3.25
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM83GA6ND36 823 aa35.31■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.3■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.28■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 VPS72Q15906 364 aa35.27■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 NLRP13Q86W25 1043 aa35.27■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 AKAP12Q02952 1782 aa35.27■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 NRAPQ86VF7 1730 aa35.26■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC24A1O60721 1099 aa35.26■■■■□ 3.24
TM7SF3-212ENST00000543088 GLI3P10071 1580 aa35.25■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 BTG4Q9NY30 223 aa35.25■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.25■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 USP19O94966 1318 aa35.24■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 KIAA0232Q92628 1395 aa35.23■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 SSH2Q76I76 1423 aa35.21■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.2■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
TM7SF3-212ENST00000543088 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 USP47Q96K76 1375 aa35.18■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PIK3C2AO00443 1686 aa35.17■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 NLRP6P59044 892 aa35.17■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.16■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.16■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 CPDO75976 1380 aa35.15■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TMC1Q8TDI8 760 aa35.15■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TESK2Q96S53 571 aa35.15■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.14■■■■□ 3.22
TM7SF3-212ENST00000543088 GCP02774 474 aa35.13■■■■□ 3.21
TM7SF3-212ENST00000543088 CHRNA2Q15822 529 aa35.13■■■■□ 3.21
TM7SF3-212ENST00000543088 SLIT3O75094 1523 aa35.12■■■■□ 3.21
TM7SF3-212ENST00000543088 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
TM7SF3-212ENST00000543088 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.11■■■■□ 3.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.09■■■■□ 3.21
TM7SF3-212ENST00000543088 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.07■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.07■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.06■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 TMF1P82094 1093 aa35.06■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.06■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.06■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 A0A0G2JS52 829 aa35.05■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 MYT1Q01538 1121 aa35.05■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 STRN4Q9NRL3 753 aa35.05■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.04■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 EVA1CP58658 441 aa35.03■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.03■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.03■■■■□ 3.2
TM7SF3-212ENST00000543088 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
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TM7SF3-212ENST00000543088 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.01■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 A0A1W2PP64 1363 aa35■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.99■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 CDCA8Q53HL2 280 aa34.99■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.98■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 USP54Q70EL1 1684 aa34.98■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.98■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 EP400Q96L91 3159 aa34.97■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 USP31Q70CQ4 1352 aa34.96■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.95■■■■□ 3.19
TM7SF3-212ENST00000543088 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
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TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC125Q86Z20 511 aa34.93■■■■□ 3.18
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TM7SF3-212ENST00000543088 SOX12O15370 315 aa34.91■■■■□ 3.18
TM7SF3-212ENST00000543088 NME9Q86XW9 330 aa34.91■■■■□ 3.18
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.9■■■■□ 3.18
TM7SF3-212ENST00000543088 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.89■■■■□ 3.18
TM7SF3-212ENST00000543088 USP35Q9P2H5 1018 aa34.89■■■■□ 3.18
TM7SF3-212ENST00000543088 COL18A1P39060 1754 aa34.88■■■■□ 3.17
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCC6O95255 1503 aa34.87■■■■□ 3.17
TM7SF3-212ENST00000543088 CRB1P82279 1406 aa34.87■■■■□ 3.17
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