RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.36■■□□□ 1.97
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.36■■□□□ 1.97
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.35■■□□□ 1.97
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.33■■□□□ 1.97
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COG3Q96JB2 828 aa27.32■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.32■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 INSRP06213 1382 aa27.32■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.31■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATF3P18847 181 aa27.3■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DCCP43146 1447 aa27.29■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CFAP53Q96M91 514 aa27.29■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ORAI2Q96SN7 254 aa27.28■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.27■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.27■■□□□ 1.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.26■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FBLN1P23142 703 aa27.25■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 POLKQ9UBT6 870 aa27.25■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.25■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.25■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.25■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.24■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MSH6P52701 1360 aa27.24■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MST1RQ04912 1400 aa27.23■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PSME1Q06323 249 aa27.23■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SHPRHQ149N8 1683 aa27.22■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP31Q70CQ4 1352 aa27.21■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.21■■□□□ 1.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PIK3C2AO00443 1686 aa27.2■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FOXO3O43524 673 aa27.19■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.19■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF1AQ12756 1690 aa27.17■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABTB2Q8N961 1025 aa27.17■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.17■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NLRP6P59044 892 aa27.16■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUDCQ9Y266 331 aa27.13■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP54Q70EL1 1684 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SOX12O15370 315 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLAIN2Q9P270 581 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RUNDC1Q96C34 613 aa27.05■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 APAF1O14727 1248 aa27.04■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IL13P35225 146 aa27.04■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.03■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BRINP3Q76B58 766 aa27.03■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.02■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PEAK1Q9H792 1746 aa27.02■■□□□ 1.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PDE3BQ13370 1112 aa27■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SBNO1A3KN83 1393 aa26.99■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.99■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.98■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.98■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NGEFQ8N5V2 710 aa26.98■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.98■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FCHSD2O94868 740 aa26.97■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.97■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ALS2Q96Q42 1657 aa26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FLT4P35916 1363 aa26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AMPHP49418 695 aa26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PXDNQ92626 1479 aa26.95■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF521Q96K83 1311 aa26.95■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NFAT5O94916 1531 aa26.94■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP19O94966 1318 aa26.93■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GCP02774 474 aa26.93■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.93■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLIT3O75094 1523 aa26.93■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.92■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.92■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.91■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HOXC9P31274 260 aa26.91■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HMOX1P09601 288 aa26.9■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LTN1O94822 1766 aa26.89■■□□□ 1.9
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