RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
KCNS1-202ENST00000537075 EID1Q9Y6B2 187 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 LTKP29376 864 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.38■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 PDE3AQ14432 1141 aa29.35■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 CABP1Q9NZU7 370 aa29.33■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 METP08581 1390 aa29.33■■■□□ 2.29
KCNS1-202ENST00000537075 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.32■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.32■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.32■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.32■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 ATP7BP35670 1465 aa29.31■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.29■■■□□ 2.28
KCNS1-202ENST00000537075 PANK1Q8TE04 598 aa29.26■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.26■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.23■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 COG6Q9Y2V7 657 aa29.23■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 TECPR2O15040 1411 aa29.23■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 CPS1P31327 1500 aa29.23■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 DIP2AQ14689 1571 aa29.22■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 IGHDP01880 384 aa29.21■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.21■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 SIRT1Q96EB6 747 aa29.21■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.2■■■□□ 2.27
KCNS1-202ENST00000537075 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.19■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.18■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 TNNQ9UQP3 1299 aa29.18■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 TBX22Q9Y458 520 aa29.18■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.18■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 RLBP1P12271 317 aa29.17■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.17■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.16■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.16■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.16■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 C8orf34Q49A92 452 aa29.15■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.14■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
KCNS1-202ENST00000537075 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 AKAP12Q02952 1782 aa29.13■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 FAM161AQ3B820 660 aa29.13■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 POLKQ9UBT6 870 aa29.13■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 RGS3P49796 1198 aa29.12■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 PTPRUQ92729 1446 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 FBLN1P23142 703 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 IL16Q14005 1332 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 AAMPQ13685 434 aa29.09■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.09■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 ITSN1Q15811 1721 aa29.09■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 RIPK4P57078 832 aa29.08■■■□□ 2.25
KCNS1-202ENST00000537075 FCHSD2O94868 740 aa29.06■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.06■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.06■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.05■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.05■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 NME9Q86XW9 330 aa29.05■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 PIK3R4Q99570 1358 aa29.04■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 PTCH1Q13635 1447 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
KCNS1-202ENST00000537075 PRKAR2BP31323 418 aa29.01■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.01■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.01■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.01■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 NBR1Q14596 966 aa29■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.99■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.99■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.99■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.98■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.2 ms