RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 NGLY1Q96IV0 654 aa35.58■■■■□ 3.29
SERGEF-212ENST00000529728 USP47Q96K76 1375 aa35.57■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.57■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.57■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.57■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 USP6P35125 1406 aa35.56■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 SOCS7O14512 581 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 SSH2Q76I76 1423 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 SLIT2O94813 1529 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.54■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.54■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.54■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.54■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.53■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
SERGEF-212ENST00000529728 SLC24A1O60721 1099 aa35.49■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 USP21Q9UK80 565 aa35.48■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 ATRNO75882 1429 aa35.48■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.48■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 PIK3C2AO00443 1686 aa35.48■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
SERGEF-212ENST00000529728 NRAPQ86VF7 1730 aa35.44■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 USP19O94966 1318 aa35.42■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 RXRBP28702 533 aa35.42■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 ABTB2Q8N961 1025 aa35.41■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 PLEKHG5O94827 1062 aa35.39■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 FAM83GA6ND36 823 aa35.38■■■■□ 3.26
SERGEF-212ENST00000529728 USP54Q70EL1 1684 aa35.38■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.38■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 SLIT3O75094 1523 aa35.38■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.37■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.37■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.35■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 NLRP13Q86W25 1043 aa35.34■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.34■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.33■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 TMF1P82094 1093 aa35.33■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 RGS12O14924 1447 aa35.33■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 GLI3P10071 1580 aa35.33■■■■□ 3.25
SERGEF-212ENST00000529728 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 A0A1W2PP64 1363 aa35.3■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 CPDO75976 1380 aa35.3■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 KIAA0232Q92628 1395 aa35.3■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 TMC1Q8TDI8 760 aa35.3■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.3■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 MYOM1P52179 1685 aa35.28■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 NLRP6P59044 892 aa35.26■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
SERGEF-212ENST00000529728 GCP02774 474 aa35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 VPS72Q15906 364 aa35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 BTG4Q9NY30 223 aa35.24■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 USP31Q70CQ4 1352 aa35.24■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 CDCA8Q53HL2 280 aa35.22■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 COL18A1P39060 1754 aa35.22■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.2■■■■□ 3.23
SERGEF-212ENST00000529728 NFAT5O94916 1531 aa35.2■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.19■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 CHRNA2Q15822 529 aa35.17■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.14■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.223e-7■■■□□ 16.3
SERGEF-212ENST00000529728 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.14■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.14■■■■□ 3.22
SERGEF-212ENST00000529728 NME9Q86XW9 330 aa35.13■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 EP400Q96L91 3159 aa35.12■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.12■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.11■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.11■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 RGPD5Q99666 1765 aa35.1■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.09■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.09■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 LTN1O94822 1766 aa35.09■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 ABCC6O95255 1503 aa35.09■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
SERGEF-212ENST00000529728 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.07■■■■□ 3.2
SERGEF-212ENST00000529728 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.07■■■■□ 3.2
SERGEF-212ENST00000529728 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.06■■■■□ 3.2
SERGEF-212ENST00000529728 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
SERGEF-212ENST00000529728 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa35.02■■■■□ 3.2
SERGEF-212ENST00000529728 STRN4Q9NRL3 753 aa35■■■■□ 3.19
SERGEF-212ENST00000529728 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.98■■■■□ 3.19
SERGEF-212ENST00000529728 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.19
SERGEF-212ENST00000529728 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.97■■■■□ 3.19
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