RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
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TSPAN4-217ENST00000527644 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPAN4-217ENST00000527644 CABP1Q9NZU7 370 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPAN4-217ENST00000527644 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
TSPAN4-217ENST00000527644 ABCA3Q99758 1704 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPAN4-217ENST00000527644 BCL9LQ86UU0 1499 aa37.35■■■■□ 3.57
TSPAN4-217ENST00000527644 SLIT2O94813 1529 aa37.32■■■■□ 3.57
TSPAN4-217ENST00000527644 ATRNO75882 1429 aa37.32■■■■□ 3.56
TSPAN4-217ENST00000527644 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
TSPAN4-217ENST00000527644 UNC5CLQ8IV45 518 aa37.29■■■■□ 3.56
TSPAN4-217ENST00000527644 ATAD2Q6PL18 1390 aa37.29■■■■□ 3.56
TSPAN4-217ENST00000527644 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM83GA6ND36 823 aa37.25■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 ABTB2Q8N961 1025 aa37.25■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.23■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 USP6P35125 1406 aa37.22■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 NUTM2GQ5VZR2 741 aa37.22■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
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TSPAN4-217ENST00000527644 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.2■■■■□ 3.55
TSPAN4-217ENST00000527644 NWD2Q9ULI1 1742 aa37.19■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC24A1O60721 1099 aa37.18■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 PLCH1Q4KWH8 1693 aa37.18■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 NLRP13Q86W25 1043 aa37.16■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 TESK2Q96S53 571 aa37.16■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 SSH2Q76I76 1423 aa37.15■■■■□ 3.54
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TSPAN4-217ENST00000527644 VPS72Q15906 364 aa37.14■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.14■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
TSPAN4-217ENST00000527644 BTG4Q9NY30 223 aa37.13■■■■□ 3.53
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TSPAN4-217ENST00000527644 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
TSPAN4-217ENST00000527644 USP47Q96K76 1375 aa37.11■■■■□ 3.53
TSPAN4-217ENST00000527644 AKAP12Q02952 1782 aa37.1■■■■□ 3.53
TSPAN4-217ENST00000527644 KIAA0232Q92628 1395 aa37.1■■■■□ 3.53
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TSPAN4-217ENST00000527644 NLRP6P59044 892 aa37.08■■■■□ 3.53
TSPAN4-217ENST00000527644 TMC1Q8TDI8 760 aa37.08■■■■□ 3.53
TSPAN4-217ENST00000527644 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.08■■■■□ 3.53
TSPAN4-217ENST00000527644 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
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TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 GCP02774 474 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 TTC21AQ8NDW8 1320 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa37.04■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 NRAPQ86VF7 1730 aa37.04■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 NRKQ7Z2Y5 1582 aa37.04■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 CHRNA2Q15822 529 aa37.03■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 CPDO75976 1380 aa37.03■■■■□ 3.52
TSPAN4-217ENST00000527644 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
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TSPAN4-217ENST00000527644 TMF1P82094 1093 aa37■■■■□ 3.51
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TSPAN4-217ENST00000527644 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.98■■■■□ 3.51
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TSPAN4-217ENST00000527644 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
TSPAN4-217ENST00000527644 SLIT3O75094 1523 aa36.96■■■■□ 3.51
TSPAN4-217ENST00000527644 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.92■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.92■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.92■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.91■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.91■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A1W2PP64 1363 aa36.91■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 CDCA8Q53HL2 280 aa36.9■■■■□ 3.5
TSPAN4-217ENST00000527644 STRN4Q9NRL3 753 aa36.9■■■■□ 3.5
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TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.79■■■■□ 3.48
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TSPAN4-217ENST00000527644 COL18A1P39060 1754 aa36.74■■■■□ 3.47
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TSPAN4-217ENST00000527644 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.72■■■■□ 3.47
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