RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.3■■■■□ 3.4
TCEA1-202ENST00000517351 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.3■■■■□ 3.4
TCEA1-202ENST00000517351 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TCEA1-202ENST00000517351 CABP1Q9NZU7 370 aa36.28■■■■□ 3.4
TCEA1-202ENST00000517351 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
TCEA1-202ENST00000517351 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TCEA1-202ENST00000517351 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.23■■■■□ 3.39
TCEA1-202ENST00000517351 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.21■■■■□ 3.39
TCEA1-202ENST00000517351 SLIT2O94813 1529 aa36.2■■■■□ 3.39
TCEA1-202ENST00000517351 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
TCEA1-202ENST00000517351 ATRNO75882 1429 aa36.19■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.18■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.18■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 USP6P35125 1406 aa36.17■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.16■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.16■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 ABTB2Q8N961 1025 aa36.16■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
TCEA1-202ENST00000517351 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.13■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 FAM83GA6ND36 823 aa36.13■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 RGS12O14924 1447 aa36.11■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 TESK2Q96S53 571 aa36.11■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.1■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 USP47Q96K76 1375 aa36.1■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 AKAP12Q02952 1782 aa36.07■■■■□ 3.37
TCEA1-202ENST00000517351 NLRP13Q86W25 1043 aa36.07■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.06■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 SSH2Q76I76 1423 aa36.06■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 SLC24A1O60721 1099 aa36.05■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 TMC1Q8TDI8 760 aa36.04■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 USP19O94966 1318 aa36.04■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 BTG4Q9NY30 223 aa36.03■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA0232Q92628 1395 aa36.02■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 NLRP6P59044 892 aa36.01■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 VPS72Q15906 364 aa36.01■■■■□ 3.36
TCEA1-202ENST00000517351 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.01■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.99■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 NRAPQ86VF7 1730 aa35.99■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 GLI3P10071 1580 aa35.98■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 CHRNA2Q15822 529 aa35.97■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 PIK3C2AO00443 1686 aa35.97■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.97■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 GCP02774 474 aa35.96■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.96■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.96■■■■□ 3.35
TCEA1-202ENST00000517351 TMF1P82094 1093 aa35.94■■■■□ 3.34
TCEA1-202ENST00000517351 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
TCEA1-202ENST00000517351 CPDO75976 1380 aa35.91■■■■□ 3.34
TCEA1-202ENST00000517351 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.91■■■■□ 3.34
TCEA1-202ENST00000517351 SLIT3O75094 1523 aa35.91■■■■□ 3.34
TCEA1-202ENST00000517351 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.89■■■■□ 3.34
TCEA1-202ENST00000517351 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
TCEA1-202ENST00000517351 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
TCEA1-202ENST00000517351 A0A1W2PP64 1363 aa35.87■■■■□ 3.33
TCEA1-202ENST00000517351 STRN4Q9NRL3 753 aa35.84■■■■□ 3.33
TCEA1-202ENST00000517351 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TCEA1-202ENST00000517351 CDCA8Q53HL2 280 aa35.83■■■■□ 3.33
TCEA1-202ENST00000517351 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.82■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.82■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.82■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.81■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.81■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.81■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.81■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 EVA1CP58658 441 aa35.8■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 NME9Q86XW9 330 aa35.8■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.79■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 USP31Q70CQ4 1352 aa35.78■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 SOX12O15370 315 aa35.78■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 A0A0G2JS52 829 aa35.76■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 MYT1Q01538 1121 aa35.76■■■■□ 3.32
TCEA1-202ENST00000517351 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.76■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.75■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.74■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa35.74■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 USP54Q70EL1 1684 aa35.74■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.72■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 NFAT5O94916 1531 aa35.71■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
TCEA1-202ENST00000517351 COL18A1P39060 1754 aa35.69■■■■□ 3.3
TCEA1-202ENST00000517351 USP35Q9P2H5 1018 aa35.68■■■■□ 3.3
TCEA1-202ENST00000517351 KRT27Q7Z3Y8 459 aa35.66■■■■□ 3.3
TCEA1-202ENST00000517351 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.66■■■■□ 3.3
TCEA1-202ENST00000517351 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.66■■■■□ 3.3
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