RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514514.5

PAIP1-208, Transcript of poly(A) binding protein interacting protein 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PAIP1, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAIP1-208	ENST00000514514	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PAIP1-208	ENST00000514514	NME9	Q86XW9	330 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PAIP1-208	ENST00000514514	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PAIP1-208	ENST00000514514	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.39	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	MST1R	Q04912	1400 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	MSH6	P52701	1360 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	ATF3	P18847	181 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PAIP1-208	ENST00000514514	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	COG3	Q96JB2	828 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	MTHFS	P49914	203 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PAIP1-208	ENST00000514514	INSR	P06213	1382 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	USP31	Q70CQ4	1352 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	PSME1	Q06323	249 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PAIP1-208	ENST00000514514	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.19	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	FOXO3	O43524	673 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	FBLN1	P23142	703 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PAIP1-208	ENST00000514514	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	NLRP6	P59044	892 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PAIP1-208	ENST00000514514	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	PXDN	Q92626	1479 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PAIP1-208	ENST00000514514	SLIT3	O75094	1523 aa		32	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	NFAT5	O94916	1531 aa		32	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	SOX12	O15370	315 aa		32	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	USP19	O94966	1318 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PAIP1-208	ENST00000514514	IL13	P35225	146 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	LTN1	O94822	1766 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	FLT4	P35916	1363 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PAIP1-208	ENST00000514514	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	AMPH	P49418	695 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	APAF1	O14727	1248 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	GC	P02774	474 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	HOXC9	P31274	260 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PAIP1-208	ENST00000514514	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		31.83	■■■□□ 2.69

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