RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.3□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 GCC1Q96CN9 775 aa7.3□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 USP35Q9P2H5 1018 aa7.3□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 SPG7Q9UQ90 795 aa7.3□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 TEFQ10587 303 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 MROH2AA6NES4 1674 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.29□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 HIP1O00291 1037 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 NFE2L2Q16236 605 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 MSH6P52701 1360 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 E9PCH4 1651 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 CLTCL1P53675 1640 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 TESK2Q96S53 571 aa7.28□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
POLK-215ENST00000514141 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ARHGEF10O15013 1369 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PTPRCP08575 1304 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 HOXB7P09629 217 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PTCH1Q13635 1447 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 USP32Q8NFA0 1604 aa7.27□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 MTHFSP49914 203 aa7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 RIPK4P57078 832 aa7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 HSCBQ8IWL3 235 aa7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 FLT4P35916 1363 aa7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.26□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 KCNA6P17658 529 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 REC8O95072 547 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 MCM2P49736 904 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 FAM161AQ3B820 660 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ABCA6Q8N139 1617 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TECPR2O15040 1411 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.25□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 APAF1O14727 1248 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 SLFN5Q08AF3 891 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ERC2O15083 957 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 NLRP6P59044 892 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 CABP2Q9NPB3 220 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TICAM2Q86XR7 235 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 SBNO1A3KN83 1393 aa7.24□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 IQGAP1P46940 1657 aa7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 GBP4Q96PP9 640 aa7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 CABP1Q9NZU7 370 aa7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 RICTORQ6R327 1708 aa7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ABTB2Q8N961 1025 aa7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.22□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 ST18O60284 1047 aa7.21□□□□□ -1.25
POLK-215ENST00000514141 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms