RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 EP400Q96L91 3159 aa35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.6■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.57■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.56■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.56■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 BTG4Q9NY30 223 aa35.54■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 ACEP12821 1306 aa35.54■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC125Q86Z20 511 aa35.53■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.53■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.52■■■■□ 3.28
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.49■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.48■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.48■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 NEUROD1Q13562 356 aa35.46■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
ALYREF-203ENST00000511412 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.44■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA0232Q92628 1395 aa35.44■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0G2JS52 829 aa35.44■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 MYT1Q01538 1121 aa35.44■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.43■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 CABP2Q9NPB3 220 aa35.43■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
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ALYREF-203ENST00000511412 KRT27Q7Z3Y8 459 aa35.41■■■■□ 3.26
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.38■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.38■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 ABTB2Q8N961 1025 aa35.38■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.37■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 CHRNA2Q15822 529 aa35.36■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 USP19O94966 1318 aa35.33■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 EVC2Q86UK5 1308 aa35.33■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
ALYREF-203ENST00000511412 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.32■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 USP6P35125 1406 aa35.32■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 CABP1Q9NZU7 370 aa35.3■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.3■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 CPDO75976 1380 aa35.29■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 NLRP13Q86W25 1043 aa35.29■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 STRN4Q9NRL3 753 aa35.29■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa35.28■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.26■■■■□ 3.24
ALYREF-203ENST00000511412 SSH2Q76I76 1423 aa35.25■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.24■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.23■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 PIK3C2AO00443 1686 aa35.23■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP12Q02952 1782 aa35.22■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 SLIT3O75094 1523 aa35.22■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 GCP02774 474 aa35.21■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 EVA1CP58658 441 aa35.2■■■■□ 3.23
ALYREF-203ENST00000511412 TONSLQ96HA7 1378 aa35.19■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 USP35Q9P2H5 1018 aa35.17■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.16■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 NLRP6P59044 892 aa35.16■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 BAG6P46379 1132 aa35.15■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 FAM182BQ5T319 152 aa35.15■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.14■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
ALYREF-203ENST00000511412 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
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ALYREF-203ENST00000511412 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
ALYREF-203ENST00000511412 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.09■■■■□ 3.21
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.09■■■■□ 3.21
ALYREF-203ENST00000511412 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.09■■■■□ 3.21
ALYREF-203ENST00000511412 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.08■■■■□ 3.21
ALYREF-203ENST00000511412 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
ALYREF-203ENST00000511412 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.07■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 DISP2A7MBM2 1401 aa35.06■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 CRB1P82279 1406 aa35.06■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.06■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.05■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 COL18A1P39060 1754 aa35.04■■■■□ 3.2
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ALYREF-203ENST00000511412 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.03■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 PDE3BQ13370 1112 aa35.02■■■■□ 3.2
ALYREF-203ENST00000511412 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
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ALYREF-203ENST00000511412 TRIM37O94972 964 aa34.97■■■■□ 3.19
ALYREF-203ENST00000511412 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.97■■■■□ 3.19
ALYREF-203ENST00000511412 USP54Q70EL1 1684 aa34.96■■■■□ 3.19
ALYREF-203ENST00000511412 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.96■■■■□ 3.19
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC37A3O60309 1634 aa34.95■■■■□ 3.19
ALYREF-203ENST00000511412 SOX12O15370 315 aa34.94■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 RGPD5Q99666 1765 aa34.94■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.93■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.92■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.92■■■■□ 3.18
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