RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, human

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITX1-206	ENST00000507253	USP21	Q9UK80	565 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PITX1-206	ENST00000507253	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PITX1-206	ENST00000507253	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PITX1-206	ENST00000507253	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	RXRB	P28702	533 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	SLC24A1	O60721	1099 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	USP6	P35125	1406 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	USP47	Q96K76	1375 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	SLIT2	O94813	1529 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PITX1-206	ENST00000507253	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	ATRN	O75882	1429 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PITX1-206	ENST00000507253	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	TESK2	Q96S53	571 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	USP19	O94966	1318 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PITX1-206	ENST00000507253	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		33.2	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	TMC1	Q8TDI8	760 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	RGS12	O14924	1447 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	TMF1	P82094	1093 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	NRAP	Q86VF7	1730 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	NLRP6	P59044	892 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PITX1-206	ENST00000507253	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	VPS72	Q15906	364 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	BTG4	Q9NY30	223 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	SLIT3	O75094	1523 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	CDCA8	Q53HL2	280 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	CPD	O75976	1380 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	GLI3	P10071	1580 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	GC	P02774	474 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253		A0A1W2PP64	1363 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PITX1-206	ENST00000507253	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PITX1-206	ENST00000507253	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PITX1-206	ENST00000507253	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PITX1-206	ENST00000507253	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PITX1-206	ENST00000507253	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.02	■■■□□ 2.88
PITX1-206	ENST00000507253	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	33.01	■■■□□ 2.87
PITX1-206	ENST00000507253	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33	■■■□□ 2.87
PITX1-206	ENST00000507253	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		33	■■■□□ 2.87
PITX1-206	ENST00000507253	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PITX1-206	ENST00000507253	EVA1C	P58658	441 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PITX1-206	ENST00000507253	STRN4	Q9NRL3	753 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PITX1-206	ENST00000507253	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	NME9	Q86XW9	330 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	NFAT5	O94916	1531 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	MYOM1	P52179	1685 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.9	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	ABCC6	O95255	1503 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	COL18A1	P39060	1754 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	SOX12	O15370	315 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX1-206	ENST00000507253	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PITX1-206	ENST00000507253		A0A0G2JS52	829 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PITX1-206	ENST00000507253	MYT1	Q01538	1121 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PITX1-206	ENST00000507253	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PITX1-206	ENST00000507253	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PITX1-206	ENST00000507253	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PITX1-206	ENST00000507253	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.85	■■■□□ 2.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms